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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001262`

染色体: Chr06 坐标: 13156190-13162570 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001262`
名称	SmilChr06G001262
描述	transcription factor PRE1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13156190 - 13162570 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988818`
GeneID	`130988818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988818`
原始查询	`LOC130988818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor PRE1-like
产物	transcription factor PRE1-like
Arabidopsis	`AT3G28857` (PRE5) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745895] identity=60.9; qcov=1; evalue=2.52e-35; confidence=medium
Rice	`Os10g0403800` (OsBUL3) - identity=51.1; qcov=1; evalue=3.69e-26; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0040008 (regulation of growth); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF23174 (bHLH_ILI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768767.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768767.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768767.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768767.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13156229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B83,C21
`Chr6:13162436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:13162535`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B113,B132,B31,B8,C3,C39,C7,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768767.1

92 aa

bHLH_ILI

PF23174 bHLH_ILI 16-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768767.1`	Pfam	`PF23174`	bHLH_ILI	Domain	16	92	2.7e-25	89.3	ILI bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912784.1
CTCATTTTTTTAAGGATGACAGGGAGAAGGTCAAGGCAGGCAAGTGGTTCTTCGAGGATAAGTGATGATCAAATTATTGAATTAGTGTCCAAACTGCATCAACTCCTTCCTCATCAGGTTCCAAACTCTAGACGCTCCAATAAGGCATCAGCATATAAAGTGCTTCAAGAAACTTGCAACTATGTTAGAAGCTTACAGAAAGAGATGGATGATTTGAGTGCGAGGTTATCAGAGTTGTTATCTACGATAGATAATGACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988818
ATGACAGGGAGAAGGTCAAGGCAGGCAAGTGGTTCTTCGAGGATAAGTGATGATCAAATTATTGAATTAGTGTCCAAACTGCATCAACTCCTTCCTCATCAGGTTCCAAACTCTAGACGCTCCAATAAGGCATCAGCATATAAAGTGCTTCAAGAAACTTGCAACTATGTTAGAAGCTTACAGAAAGAGATGGATGATTTGAGTGCGAGGTTATCAGAGTTGTTATCTACGATAGATAATGACACCCCCCAAGCTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768767.1
MTGRRSRQASGSSRISDDQIIELVSKLHQLLPHQVPNSRRSNKASAYKVLQETCNYVRSLQKEMDDLSARLSELLSTIDNDTPQAEIIRALI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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