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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002988`

染色体: Chr01 坐标: 48814174-48816521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002988`
名称	SmilChr01G002988
描述	probable receptor-like protein kinase At5g20050
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48814174 - 48816521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988853`
GeneID	`130988853`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988853`
原始查询	`LOC130988853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable receptor-like protein kinase At5g20050
产物	probable receptor-like protein kinase At5g20050
Arabidopsis	`AT5G20050` (AT5G20050) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832127] identity=64.4; qcov=0.891; evalue=8.85e-173; confidence=high
Rice	`Os06g0142650` - identity=59; qcov=0.763; evalue=1.38e-131; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988853

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768795.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768795.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768795.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768795.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48815116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:48815567`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr1:48815567`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr1:48815569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:48815746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B46,B90,B92
`Chr1:48815753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:48815934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B67,B85
`Chr1:48815943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48816067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:48816070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:48816106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:48816175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B46,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768795.1

451 aa

226

451

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 107-386 aa PF00069 Pkinase 108-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768795.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	107	386	4.9e-34	118.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057768795.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	108	385	3.6e-40	138.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912812.1
TTAAAAAATACGTATATGAATAAAGAAAGACGTAGCTGTGTCTGACATGAAAATTGAAGTAGTGAGTAGGCCAACGTTCAAGATTCATGAAGAAGAGGTAAAATAAAAACTTACGAATAAGTCTTTTCATAATTTTAAAATGAAGATTTCAATAGCAACTGCAGTCAACTAAACTCAAACCTCTGAACTTCAAGCTCTGATCATGGAGATCAAAATAACTACTACTGCTTCTTCCATTTCCTCTTTCGTTTGATTGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988853
ATGGAGGACAAACGAGCAATCTTAATCTCCATCTCCATAATCCTGCTCCTCATAACCTCCATCATCATCGCTCGAGTCTCCCTCAAACTCTCCGAGACCTTCTATCTCATCTGCGGCGCCGCCGTCGCCGCCATTTTCGCCGTCGCCGTGATCGTCGTTATCCGGATTCGCTACAACAGCCGCCGCAAGCAGCTCGAGCACCAGATCGATTTCCAGGGGCGCGAGCTGCGGATTGAGTACAGCTTCCTCCGCAAAGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768795.1
MEDKRAILISISIILLLITSIIIARVSLKLSETFYLICGAAVAAIFAVAVIVVIRIRYNSRRKQLEHQIDFQGRELRIEYSFLRKVAGVPTKFRHRELEEATDGFRALLGRGGSGSVYKGILSDGTAVAVKRIEGEERAEKAFKSEVAAIASVQHVNLARLLGYCIASGGGPRFLVYEFVFNGSLDNWIFPKIRANQRSGCLTWDLRCRVALDVAKALSYLHHDCRSCVLHLDVKPENILLDENYRALVSDFGLSKLKGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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