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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002991`

染色体: Chr01 坐标: 48828537-48832816 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002991`
名称	SmilChr01G002991
描述	phospholipase D alpha 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48828537 - 48832816 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988862`
GeneID	`130988862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988862`
原始查询	`LOC130988862`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase D alpha 1-like
产物	phospholipase D alpha 1-like
Arabidopsis	`AT1G52570` (PLDALPHA2) phospholipase D alpha 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841689] identity=64.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0172400` (OsPLDalpha1) - identity=66.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004630 (D-type glycerophospholipase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009395 (phospholipid catabolic process); GO:0046470 (phosphatidylcholine metabolic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF00614 (PLDc); PF13091 (PLDc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768808.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768808.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057768808.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768808.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48828758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C65
`Chr1:48828913`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr1:48828913`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr1:48829341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:48829719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:48829897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B67,B85,C31
`Chr1:48829904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:48829934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B67,B85,C31
`Chr1:48829971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B67,B85,C31
`Chr1:48830289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B114,B65,B69,C77
`Chr1:48830361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:48830388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768808.1

807 aa

404

807

PLDc

PLDc_2

PF00168 C2 45-127 aa PF00614 PLDc 219-795 aa PF13091 PLDc_2 653-686 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768808.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	45	127	8.3e-09	36.3	C2 domain
`XP_057768808.1`	Pfam	`PF00614`	PLDc	Domain	219	795	4.5e-229	762.2	Phospholipase D
`XP_057768808.1`	Pfam	`PF13091`	PLDc_2	Domain	653	686	5.5e-09	36.6	Cardiolipin synthase, PLD-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912825.1
CTCCTCATCTCCCGCCACACATTAATTAGTCAAGTCAACTTCCACACACACACGCGCGCACAAATAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAAATAAATATTTGTGCATGCGTATAGTTGTCTCTGGTCCAGAAAATACGATCTTCTGCATAATATATGTGGAATTCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAATAAGAAGGATATATAGAGATGGCAGATCAAATTTTACTCCACGGAGATCTACATGCAACTATCTATGAGATCGACAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988862
ATGGCAGATCAAATTTTACTCCACGGAGATCTACATGCAACTATCTATGAGATCGACAATCTCCATCTTGGATTTCTTGCCAAGTTTTATCATAAGGTGATAGAAGGCATCGAAGAAGCAGCAGGTTTCAACAACACAGCTTCACGGCTCTACGCGACGATCGACTTAGAGAAAACTCGAGTCGGCCGCACCCGGCGACTTCACGACCACGACTCCAATCCTCGCTGGGATGAATCCTTCCACATCTACTGCGCCCACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768808.1
MADQILLHGDLHATIYEIDNLHLGFLAKFYHKVIEGIEEAAGFNNTASRLYATIDLEKTRVGRTRRLHDHDSNPRWDESFHIYCAHAASKLVFTIKLDNPVGTKLVGTAEIPVTDLIRGDPLDTWLDILNRRRKPIHGNSKLRVRLHFYDVKRERCWSRGLKSPNFPGVPYTFFPQRTGCRVTLYQDAHVADGFLPAIQLAGGKQYRPRRCWEDVFDVISNAKHMIYITGWSVYTKITLVRDVAGAKITLGELLIKKANE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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