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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001373`

染色体: Chr06 坐标: 14392544-14394418 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001373`
名称	SmilChr06G001373
描述	ras-related protein RABA4d-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14392544 - 14394418 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988867`
GeneID	`130988867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988867`
原始查询	`LOC130988867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABA4d-like
产物	ras-related protein RABA4d-like
Arabidopsis	`AT3G12160` (RABA4D) RAB GTPase homolog A4D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820393] identity=81.4; qcov=1; evalue=2.1e-132; confidence=high
Rice	`Os10g0377400` (OsRab11E1) - identity=74.3; qcov=0.959; evalue=7.54e-117; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005768 (endosome)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057768817.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057768817.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057768817.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057768817.1`
5	Endosome	内体	1.00000	`XP_057768817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14392848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr6:14392892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:14392901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:14393006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B66,C53
`Chr6:14393033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,C32,C49,C53
`Chr6:14393167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C37
`Chr6:14393200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:14393907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:14393958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768817.1

219 aa

110

219

Arf

MMR_HSR1

Roc

Ras

PF00025 Arf 16-154 aa PF01926 MMR_HSR1 18-125 aa PF08477 Roc 18-132 aa PF00071 Ras 18-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768817.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	16	154	2.2e-13	50.8	ADP-ribosylation factor family
`XP_057768817.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	18	125	5.2e-06	27.3	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057768817.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	18	132	1.3e-34	119.7	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057768817.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	18	178	2.8e-63	213.0	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912834.1
AAAGGGAAAAAGAGTAATCTCCGCTAAAAAAACCGTTTGATGGGCCCCGCAGTTGTCGTTGGTTCATTTCCTGGCATTTCCTGCTCAGCTTTGATCCTTTGCTACCCAAAAGCTCCCAAGAAAAAAAAAATCCCATTTTCCCACGAACCCTAATCCCAAATCTTCGATCCACTCATTTCCGCTCGAAACTCACTCCAGCTAGCCAGAGAATTATATAATTTTCGCGGTTTCGGATGAAAACGATTGAATTTCCCGTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988867
ATGTCAAATTTATATGGAGGGGATTTTAATCAGAAGATTGATTATGTGTTCAAGGTTGTGTTAATTGGGGATTCCGCAGTCGGGAAATCGCAGTTGTTGTCTAGGTTTGCGAGGAATGAATTCAGCTTGGAGTCGAAGGCCACAATTGGGGTTGAATTCCAGACCAAGACACTTCTCATTGATCAAAAAACTGTCAAGGCACAGATTTGGGATACTGCAGGTCAAGAAAGGTATCGAGCAGTGACAAGTGCGTATTACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768817.1
MSNLYGGDFNQKIDYVFKVVLIGDSAVGKSQLLSRFARNEFSLESKATIGVEFQTKTLLIDQKTVKAQIWDTAGQERYRAVTSAYYRGAVGAMLVYDITKRQSFDHMARWLEELRGHADKNIVIMLIGNKSDLGTLRAVPTEDAQEFAERENLYFMETSALQATNVEGAFMTILTEIYRIVSKKTLAANGEYSKSSSLKGTAIIVTGQGDANSKSGCCT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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