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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002989`

染色体: Chr01 坐标: 48818132-48823250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002989`
名称	SmilChr01G002989
描述	uncharacterized SmilChr01G002989
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48818132 - 48823250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988868`
GeneID	`130988868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988868`
原始查询	`LOC130988868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0175000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0175000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G20060` (AT5G20060) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832128] identity=68.8; qcov=0.988; evalue=2.18e-129; confidence=high
Rice	`Os01g0175000` - identity=70.3; qcov=0.984; evalue=2.96e-134; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02230 (Abhydrolase_2); PF03959 (FSH1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768820.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768820.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768820.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768820.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768820.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48818421`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr1:48818421`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B66
`Chr1:48818549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:48818552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D7
`Chr1:48819404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C59,D10
`Chr1:48819515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:48822244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768820.1

253 aa

126

253

Abhydrolase_2

FSH1

PF02230 Abhydrolase_2 23-244 aa PF03959 FSH1 79-203 aa

XP_057768828.1

253 aa

126

253

Abhydrolase_2

FSH1

PF02230 Abhydrolase_2 23-244 aa PF03959 FSH1 79-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768820.1`	Pfam	`PF02230`	Abhydrolase_2	Domain	23	244	2.4e-40	139.4	Phospholipase/Carboxylesterase
`XP_057768820.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	79	203	3.2e-07	31.0	Serine hydrolase (FSH1)
`XP_057768828.1`	Pfam	`PF02230`	Abhydrolase_2	Domain	23	244	2.4e-40	139.4	Phospholipase/Carboxylesterase
`XP_057768828.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	79	203	3.2e-07	31.0	Serine hydrolase (FSH1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912837.1
TATTAGAAAATAGAAAGGAGAAAGAGTTAGTAGAGGAGTGCTTAGTTCTTTGTTGGGGGAAATGTGAAGCAATAATCGGTTTTCATTTTTCACAATTTACAGAGCAACGACCAAGACTACCAGCTTCGCTACTCTCGAGTCTCGACAACACGACCTCTTCAGGTGCAATTCTCTCTCGCAGCAGTAAGCTGCTGTTATCATTTATCGGGAGGAATATGAGTTTCACTGGCCCTTCCGCTGCGGCTTCTGCTGCTGGGAGA...

XM_057912845.1
CAACACGACCTCTTCAGGTATACCATTCACGTCGATCAATTCATCCCAATAAATCTTCTTCTCCACAAGTCTGTCAAATCGCTATCTTTTTTCCACTTAATTAGGAGCTTCGTCTTCTGCAATTTCTCGTATCGTTGAGGTGCAATTCTCTCTCGCAGCAGTAAGCTGCTGTTATCATTTATCGGGAGGAATATGAGTTTCACTGGCCCTTCCGCTGCGGCTTCTGCTGCTGGGAGAACTTTTGACTTTGGACGAACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988868
ATGAGTTTCACTGGCCCTTCCGCTGCGGCTTCTGCTGCTGGGAGAACTTTTGACTTTGGACGAACATATGTGGTCAGGCCTAAAGGTAAACACCAAGCGACCATTGTGTGGCTGCATGGCCTTGGGGACAACGGCAATAGCTGGTCTACTCTCTTGGAAACCCTCCCGCTTCCAAATATAAAGTGGATCTGCCCAACTGCTCCTCAACGGCCAGTAACTTTATTTGGAGGCTTTCCATCAACTGCCTGGTTTGATGTGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768820.1
MSFTGPSAAASAAGRTFDFGRTYVVRPKGKHQATIVWLHGLGDNGNSWSTLLETLPLPNIKWICPTAPQRPVTLFGGFPSTAWFDVNDLSEDANDDIHGLEASATYVASLLANEPADIKLGVGGFSMGAATSLYCATCFARGKFENGNQFSPNISAVVGLSGWLPCAKSLSNKLEGVAEASGRAASLPVLLCHGKGDDVVAYKFGEKSAQKLSSTGFRDVTFKSYTTLGHYTIPEEMDELCTWLCSKMGLDGK

XP_057768828.1
MSFTGPSAAASAAGRTFDFGRTYVVRPKGKHQATIVWLHGLGDNGNSWSTLLETLPLPNIKWICPTAPQRPVTLFGGFPSTAWFDVNDLSEDANDDIHGLEASATYVASLLANEPADIKLGVGGFSMGAATSLYCATCFARGKFENGNQFSPNISAVVGLSGWLPCAKSLSNKLEGVAEASGRAASLPVLLCHGKGDDVVAYKFGEKSAQKLSSTGFRDVTFKSYTTLGHYTIPEEMDELCTWLCSKMGLDGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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