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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000795`

染色体: Chr01 坐标: 17225327-17227987 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000795`
名称	SmilChr01G000795
描述	uncharacterized SmilChr01G000795
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17225327 - 17227987 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988889`
GeneID	`130988889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988889`
原始查询	`LOC130988889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=33.9; qcov=0.669; evalue=3.98e-75; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768875.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768875.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768875.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768875.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17225332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:17225339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B36
`Chr1:17225367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr1:17225378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:17225390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B109,B11,B114,B122,B17,B24,B25,B73,C30,C48,C8
`Chr1:17225491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:17225511`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A1,A2,A23,A7,A9,B104,B106,B109,B114,B119,B123,B127,B129,B13,B130,B134,B139,B17,B18,B25,B30,B34,B40,B41,B44,B45,B53,B55,B56,B73,B82,B87,B96,B97,C17,C21,C31,C35,C36,C40,C41,C44,C49,C54,C65,C67,C70,C73,C76,D4,D6
`Chr1:17225592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B13,C64
`Chr1:17225602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:17225611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:17225650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C87
`Chr1:17225652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768875.1

658 aa

329

658

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 233-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768875.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	233	397	1.8e-45	156.2	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912892.1
ATGTGGGGCGGAGAGAATGTGGAGCAGAACAAATCTAAAACCCCAAAATTTTCTTTATGTTGTTTGAAAGGCAGAGTCGTCCTTCCACTCCTGCAAAATCCACCTCAGTTGTTGAGCGATCTTTTGGAAAATAAGCACCACAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCATACAACATGATGTTCTCATTTACTTCGATGGGTGGAAAATTGGACAATTCTATTAACAAAGGTGCAGATTGTGAAATAGAACACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988889
ATGTGGGGCGGAGAGAATGTGGAGCAGAACAAATCTAAAACCCCAAAATTTTCTTTATGTTGTTTGAAAGGCAGAGTCGTCCTTCCACTCCTGCAAAATCCACCTCAGTTGTTGAGCGATCTTTTGGAAAATAAGCACCACAAGAGCAAGAAATTTATCGAGGATATTCGTGCATACAACATGATGTTCTCATTTACTTCGATGGGTGGAAAATTGGACAATTCTATTAACAAAGGTGCAGATTGTGAAATAGAACACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768875.1
MWGGENVEQNKSKTPKFSLCCLKGRVVLPLLQNPPQLLSDLLENKHHKSKKFIEDIRAYNMMFSFTSMGGKLDNSINKGADCEIEHRMNAVSKGNPKDLDDSIVLDLKQMIDSNSPYAKIYRMAADHISRNTYLDLKIRLIGKRSKDGRAYNMPTAPEVAALIVGDFETIPDKRDVIVEKRCGKLQRIDEFHPSYLLLQYPLIFIYGEDGYYLDIPHAEFDASKRNKLTLREFLAFRIQDRENEGHQLLLARRLLQQFIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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