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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001402`

染色体: Chr06 坐标: 14713388-14716470 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001402`
名称	SmilChr06G001402
描述	squamosa promoter-binding-like protein 17
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	14713388 - 14716470 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988895`
GeneID	`130988895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988895`
原始查询	`LOC130988895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 17
产物	squamosa promoter-binding-like protein 17
Arabidopsis	`AT2G42200` (SPL9) squamosa promoter binding protein-like 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818820] identity=39.4; qcov=1.05; evalue=1.41e-54; confidence=medium
Rice	`Os08g0509600` (WFP) - identity=35.5; qcov=0.925; evalue=9.51e-45; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768846.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768846.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768846.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768846.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:14716187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A7,B102,B26,B81
`Chr6:14716211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768846.1

354 aa

177

354

SBP

PF03110 SBP 69-142 aa

XP_057768847.1

347 aa

174

347

SBP

PF03110 SBP 62-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768846.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	69	142	5.8e-33	113.7	SBP domain
`XP_057768847.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	62	135	5.6e-33	113.8	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912864.1
CTCTAGCTCATCCCCTTATAAATACAAAAGGAACTTAAATATCACAATATTTTAGTTAAATGGAAATCTTTGTATATAGTATAAAGAAATAGATCTTCAGGGGTTCACCCAGAGAGAGAAAAAGAGAGAGAGATCATCGTCCTTAGCTAGCAGCCCCCACCACTGAAATGAGTAAATGAAGTTTAAGTCAGACATCACAAACAACATATTACAGGAAAGGAAGAGCTGGTTGTGTAATTTCAATCTTGAGAGAGAGAGAG...

XM_057912863.1
TCTTTGTATATAGTATAAAGAAATAGATCTTCAGGGGTTCACCCAGAGAGAGAAAAAGAGAGAGAGATCATCGTCCTTAGCTAGCAGCCCCCACCACTGAAATGAGTAAATGAAGTTTAAGTCAGACATCACAAACAACATATTACAGGAAAGGAAGAGCTGGTTGTGTAATTTCAATCTTGAGAGAGAGAGAGAGCAGCAGCAGAAAAAAGGCTACAAGGAAAAACGACAGTTGAGTTATTGACCGAAAAAGTAGCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988895
ATGGCCCATTTGTCAGGTGGTGGTGGGGCTGACTCGATCAATGGCTTGAAGTTTGGCAAGAAAATCTACTTTGAAGGTGTGGGTTCAAGAATTGGTGGTGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCGCCGCGCTCTCCGGCCAAGAAGGGAAGGACTGCGGTGGTGCAGGGAGGGCAGCCGCCTCGATGCCAGGTGGAGGGGTGTATGGTAGATCTGAGTGATTCCAAGGCTTATTATTGTAGGCACAAAGTTTGTGGTGAGCA...

LOC130988895
ATGGAAAAGGGCTCATCCTCTTCTTCTTCTTCATCAGGTGGTGGTGGGGCTGACTCGATCAATGGCTTGAAGTTTGGCAAGAAAATCTACTTTGAAGGTGTGGGTTCAAGAATTGGTGGTGGGGAGGAGGAGGAGGCGGCGCCGCCGCGCTCTCCGGCCAAGAAGGGAAGGACTGCGGTGGTGCAGGGAGGGCAGCCGCCTCGATGCCAGGTGGAGGGGTGTATGGTAGATCTGAGTGATTCCAAGGCTTATTATTGTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768846.1
MEKGSSSSSSSSGGGGADSINGLKFGKKIYFEGVGSRIGGGEEEEAAPPRSPAKKGRTAVVQGGQPPRCQVEGCMVDLSDSKAYYCRHKVCGEHSKSPMVIVAGLEQRFCQQCSRFHQLPEFDQGKRSCRRRLAGHNERRRKPPPGPLLSSRYASLSPSVLTGGGLETDFSAYSTFGGRDPWPDSSKQRGLADQTTSTGNFQLPWQMSSQASPPNLLQGSTTRSSYAAAEDCFSGISDSTSALSLLSNEPWGSRSQALDL...

XP_057768847.1
MAHLSGGGGADSINGLKFGKKIYFEGVGSRIGGGEEEEAAPPRSPAKKGRTAVVQGGQPPRCQVEGCMVDLSDSKAYYCRHKVCGEHSKSPMVIVAGLEQRFCQQCSRFHQLPEFDQGKRSCRRRLAGHNERRRKPPPGPLLSSRYASLSPSVLTGGGLETDFSAYSTFGGRDPWPDSSKQRGLADQTTSTGNFQLPWQMSSQASPPNLLQGSTTRSSYAAAEDCFSGISDSTSALSLLSNEPWGSRSQALDLGVSSFLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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