当前解析结果
SmilChr06G001411| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001411 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001411 |
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 14808143 - 14810343 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988902 |
|---|---|
| GeneID | 130988902 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988902 |
| 原始查询 | LOC130988902 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein POLYCHOME-like |
| 产物 | protein POLYCHOME-like |
| Arabidopsis | AT2G42260 (UVI4)uv-b-insensitive 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818827] identity=42.4; qcov=1.04; evalue=2.09e-46; confidence=medium |
| Rice | Os04g0472700- identity=31.8; qcov=0.697; evalue=1.64e-12; confidence=low |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0051783 (regulation of nuclear division); GO:1904667 (negative regulation of ubiquitin protein ligase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988902 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768864.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057768864.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057768864.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057768864.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768864.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:14808736 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B140 |
Chr6:14809195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C6 |
Chr6:14809224 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:14809225 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr6:14809312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr6:14809330 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,B63 |
Chr6:14809412 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr6:14809508 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,B97,C38 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。