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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001934`

染色体: Chr06 坐标: 23545456-23550694 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001934`
名称	SmilChr06G001934
描述	casein kinase II subunit alpha-2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	23545456 - 23550694 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988911`
GeneID	`130988911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988911`
原始查询	`LOC130988911`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casein kinase II subunit alpha-2-like
产物	casein kinase II subunit alpha-2-like
Arabidopsis	`AT3G50000` (CKA2) casein kinase II, alpha chain 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824162] identity=92.8; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0114400` (OsCKA2-2) - identity=94.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0005956 (protein kinase CK2 complex); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768879.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768879.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057768879.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768879.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:23545780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:23545934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr6:23548921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:23548996`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,C80
`Chr6:23548996`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C31,C80
`Chr6:23549553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B139,B32,C4
`Chr6:23549609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768879.1

334 aa

167

334

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 34-319 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 36-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768879.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	34	319	6.3e-64	216.6	Protein kinase domain
`XP_057768879.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	36	236	7.8e-19	68.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912896.1
TACAATTTAGAATAAAAATGAAAATGAAAAGGCCAATAGTTGGAGTGCTCCACAAATTTAAAGCTGGGCTAATACTAAACTAAGCTCAGTAGGCCGCTGGCGCACTACTCCGGAATTTCGCTCGTGTCGCTTGCGCCGGCTGCTCGTTTATCCGCCGTCGCCTCATCCTTATATATCTCACATAGATCTACGGATTCCTACCGCCGGAGATCATGTCGAAAGCGCGGGTCTATACCGACGTGAATGTGCTGCGCCCCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988911
ATGTCGAAAGCGCGGGTCTATACCGACGTGAATGTGCTGCGCCCCAGGGAATACTGGGATTACGAAAACCTAGCTGTGCAGTGGGGCGACCAGGATGATTATGAGGTTGTGCGCAAAGTTGGACGGGGGAAATACAGTGAAGTTTTTGAAGGTATAAATGTCAACAACAACGAGCGATGCATAATCAAGATTCTGAAACCTGTTAAGAAGAAAAAGATCAAGAGAGAGATCAAAATACTACAGAACCTGCGTGGGGGACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768879.1
MSKARVYTDVNVLRPREYWDYENLAVQWGDQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNERCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLRGGPNVVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEFVNSTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNQDQLVKIAKVLGTDELNAYLHKYHLEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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