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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001940`

染色体: Chr06 坐标: 23809099-23812672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001940`
名称	SmilChr06G001940
描述	probable esterase D14L
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	23809099 - 23812672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988917`
GeneID	`130988917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988917`
原始查询	`LOC130988917`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable esterase D14L
产物	probable esterase D14L
Arabidopsis	`AT4G37470` (KAI2) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829902] identity=77.3; qcov=0.996; evalue=1.66e-161; confidence=high
Rice	`Os11g0384789` (D14L) - identity=80.4; qcov=1; evalue=1.04e-162; confidence=high
GO	GO:0080167 (response to karrikin)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768886.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768886.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768886.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768886.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:23812330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768886.1

270 aa

135

270

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 19-251 aa PF12697 Abhydrolase_6 20-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768886.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	19	251	3.8e-13	50.4	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057768886.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	20	257	7.8e-15	56.8	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912903.1
AGTCCATAAAGTAGGTAACAAGTATCTGTCACAAATAATGTCACATTTTCAATTCCAAATAAATAGACAATTCATAACATTTAATGATCCACAAATATTATCTAAACACATATCAAGTGGTCGTCATCACCCTTCAACTCATATTCCAAACCCAGCCTACAAAAACAAAAATCTCAGCCCACATCACTCCAAAAATAAAAAAATAAAAAAATGGGAATCGCCGAAGAGGCTCACAATGTCCGCGTGATCGGCTCCGGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988917
ATGGGAATCGCCGAAGAGGCTCACAATGTCCGCGTGATCGGCTCCGGGCAGCAGACGATCGTGCTCGCGCACGGCTTCGGCACGGATCAATCGGTGTGGAAGCATCTGGTGCCGCACGTGGTGGAGGATTACCGCGTGGTGCTGTACGATAACATGGGCGCCGGCACCACAAATCCGGACTACTTCGATTTCGAGAGGTATTCGACGCTGGAGGGCTACGCCTGCGACGTCCTCGCCATCCTGGACGAGCTCGAGGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768886.1
MGIAEEAHNVRVIGSGQQTIVLAHGFGTDQSVWKHLVPHVVEDYRVVLYDNMGAGTTNPDYFDFERYSTLEGYACDVLAILDELEVRSCIYVGHSVSAMIGLIASISRPDLFSKILTISASPRYMNDPDYYGGFEQSELLELFEAMKSNYKAWCDGFAPLAVGGDMESVAVQEFSRTLFNMRPDIALSVAQTIFYSDVRPLLRHVTIPCHIIQSIKDLAVPVVVSEFLHQNLGGDSIVEVMSTDGHLPQLSSPDVVVPVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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