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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002997`

染色体: Chr01 坐标: 48921328-48923133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002997`
名称	SmilChr01G002997
描述	umecyanin-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48921328 - 48923133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988918`
GeneID	`130988918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988918`
原始查询	`LOC130988918`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	umecyanin-like
产物	umecyanin-like
Arabidopsis	`AT5G20230` (BCB) blue-copper-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832145] identity=46.6; qcov=0.66; evalue=2.62e-24; confidence=medium
Rice	`Os03g0807500` (OsSCL1) - identity=42.5; qcov=0.814; evalue=1.21e-19; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768887.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768887.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768887.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768887.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48921666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:48921674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:48921726`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B18,B67,B85
`Chr1:48921726`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B18,B67,B85
`Chr1:48921737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B68,C52
`Chr1:48921758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C71
`Chr1:48922813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C35,C55
`Chr1:48922817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B85,C28,C35,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768887.1

156 aa

156

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 42-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768887.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	42	120	5e-18	65.6	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912904.1
TGAAAACGCGTTTCCGCGAAACTCTCTCCCTTGTATCCTTTGTCGAGTCAAAATCACGAATCTACAAAAGCAGACGCCCAATTTGATTTCCTCAAAGCACTATTCTTTCCTTCTCTCTATATATTTACTTAATTATTCTATCCGTAAAAACACGCTTTCCCTCACCTATATATACACCCATTTCCGACGCATGAAAATTTAAATTACTACATTTCACAACAATTTACAAAAACAAACAAAGCTAGAAGCAGCTCAGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988918
ATGGCTAACACTAAGAATTTGGTATTGTTTGGGTGGTTGGCCGCCGCCGCCCTATTAAGCGGTTGCGCCGCCGATACGTACACGGTGGGAGATGACCTCGGGTGGACGAGGCCGCCTCTTGGAGAAGTAGCCTACCAGACATGGGCTAGGCTTAAAGATTTTGACGTCGGAGACACCATAACATTCAGCTGGACTGGAACACACAATGTAGCCCAAGTGACGAAAGATGGTTACGACAACTGCAGTGCAACAAGCAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768887.1
MANTKNLVLFGWLAAAALLSGCAADTYTVGDDLGWTRPPLGEVAYQTWARLKDFDVGDTITFSWTGTHNVAQVTKDGYDNCSATSNLGPVQTVSPYNFILNSTEPYYFICTVGDHCSNGQKVTVQVRSFNAASPSLTTAAFSAIFLAVSASVALLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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