当前解析结果
SmilChr06G001950| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001950 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001950 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001950 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 24058169 - 24059557 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988927 |
|---|---|
| GeneID | 130988927 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988927 |
| 原始查询 | LOC130988927 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988927 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768894.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057768894.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768894.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768894.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057768894.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:24058331 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr6:24058462 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:24058483 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:24058648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B139,B41,B53,B78 |
Chr6:24058669 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B22,B60,C29,C75 |
Chr6:24058710 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 70 | A1,A10,A11,A16,A18,A22,A24,A25,A5,A7,A8,B104,B109,B110,B112,B120,B126,B127,B128,B130,B132,B138,B139,B18,B23,B24,B25,B27,B29,B30,B39,B40,B41,B49,B5,B52,B60,B61,B62,B63,B73,B77,B8,B84,B94,B99,C11,C14,C15,C18,C21,C22,C25,C31,C37,C4,C42,C47,C48,C61,C62,C68,C75,C77,C8,C83,D1,D2,D6,D9 |
Chr6:24058835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B104 |
Chr6:24058835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:24058858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr6:24058889 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,C62,D1 |
Chr6:24058890 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。