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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001964`

染色体: Chr06 坐标: 24607003-24608749 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001964`
名称	SmilChr06G001964
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	24607003 - 24608749 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988936`
GeneID	`130988936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988936`
原始查询	`LOC130988936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
产物	xyloglucan galactosyltransferase XLT2-like
Arabidopsis	`AT5G62220` (GT18) glycosyltransferase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836343] identity=56.5; qcov=0.842; evalue=9e-170; confidence=high
Rice	`Os06g0342000` - identity=46.7; qcov=0.972; evalue=1.47e-128; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0008378 (galactosyltransferase activity); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057768910.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057768910.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768910.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768910.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:24607131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D7
`Chr6:24607239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:24607273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C1
`Chr6:24607279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B140
`Chr6:24607325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:24607358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C1
`Chr6:24607463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C1
`Chr6:24607479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B32,B59
`Chr6:24607506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B136,B52,C82
`Chr6:24607628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:24607637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B139,B19,B32,C4
`Chr6:24607735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768910.1

469 aa

234

469

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 78-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768910.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	78	413	1.3e-62	212.5	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912927.1
TCGATTTATTATTTATTCATTGACTTCATCAGTACTCACACAACCCTACTTTCCCTTAAATTTACATTAGCTTCTTCATATTTCCAATCTCTCTAACAAAAATCTCAACTATGCTAGATCATTCAACCCCTCATTTTCATACCCACAAAAAACCAAAGAATCTCTCCCCCAAAAACACAAATTATAGAATCTTCTTCTTCAAATGCTCTCAATTATTCCTAGTTATAATCTTCCAAGTTTTCATCATACACTTCCTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988936
ATGCTAGATCATTCAACCCCTCATTTTCATACCCACAAAAAACCAAAGAATCTCTCCCCCAAAAACACAAATTATAGAATCTTCTTCTTCAAATGCTCTCAATTATTCCTAGTTATAATCTTCCAAGTTTTCATCATACACTTCCTTTTCCGGTCTCCATCGAAACCAGCATCACTACTTCATCAAGATACACAGCATAAGAATATTCCGGCGCCGGAACACGGTCGCCGCTGCAAATACGGCACGGTCTACGTGTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768910.1
MLDHSTPHFHTHKKPKNLSPKNTNYRIFFFKCSQLFLVIIFQVFIIHFLFRSPSKPASLLHQDTQHKNIPAPEHGRRCKYGTVYVYDLPAKFNQDLLDHCDDLDPWHSRCKAVSNNGLGPRAASAAVPENLAPAWYWTDMFAGEVLYHSRMLRHECRTTEPESATAFYIPFYAGLAVGKYLFTNYTARERDAPCTEMLRWVSDQPPWRRSGGANHFLMFGRMTWDFRRSRDDDWGSGFIHMPLMKRVLRVGVERDPWDPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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