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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003000`

染色体: Chr01 坐标: 48980029-48981502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003000`
名称	SmilChr01G003000
描述	lysine histidine transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48980029 - 48981502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988948`
GeneID	`130988948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988948`
原始查询	`LOC130988948`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter 1-like
产物	lysine histidine transporter 1-like
Arabidopsis	`AT5G40780` (LHT1) lysine histidine transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834078] identity=68.5; qcov=0.92; evalue=1.38e-40; confidence=medium
Rice	`Os08g0127100` (OsHT) - identity=74.2; qcov=0.93; evalue=5.13e-29; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057768924.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057768924.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057768924.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057768924.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48980047`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B39,C45
`Chr1:48980047`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B39,C45
`Chr1:48980059`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B39,C45
`Chr1:48980059`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B39,C45
`Chr1:48980074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B39,C45
`Chr1:48980074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C45
`Chr1:48980096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B63,C28,C71
`Chr1:48980100`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A20,B1,B122,B129,B23,B4,B46,B75,B90,B95,C1,C13,C36,C41,C52,C74,C83
`Chr1:48980122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B97,C16,C23
`Chr1:48980243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B24,B68,B70,C23
`Chr1:48980257`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	B102,B103,B110,B114,B126,B135,B34,B41,B55,B58,B64,B66,B90,C26,C32,C75,C85,D3
`Chr1:48980316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768924.1

100 aa

100

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 2-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768924.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	2	94	4.5e-19	69.1	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912941.1
GTCCTCTGCCTCTGCGTGAATCCAGTCGCCCACCTCCCCGCCAAACACCGCTAGACGCCGTTCTGCCGCCACGATTCGGACGCCGTCTCCGCCTTCTGCACGGATCCAACCGCACCGTCCTCCGCCCTGCCCGCCCAAAGCTCTACCTCTCCGCCAACCACCGCCAGCCGATGTCCTGTCGCCGTGATTCAGATGTGGTCCACCGTCCCGCGATTCAGACGTCATCTTGGCCTTCTATGCGAATCCAGCCGCGCCGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988948
ATGATATATGCCATTCCAGTTTTTGACATGATGGAAAGTGTCCTTGTGAAGAAGATGAAGCTAAATCCAAGTTTGGGTTTGCGTATTATTACAAGGAATAGTTATGTTGCTTTTACAATGTTTATTGCCATCACATTCCCTTTCTTTGATGGTCTTCTTAGTTTTTTTGGAGGATTCGGTTTCGCCCCTACCACATACTTCCTTCCCTGTATCTTATGGCTCGCCATCTGCAAACGGAAGCGGTTCAGCTCCTCTTGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768924.1
MIYAIPVFDMMESVLVKKMKLNPSLGLRIITRNSYVAFTMFIAITFPFFDGLLSFFGGFGFAPTTYFLPCILWLAICKRKRFSSSWFANWVCIFSLQINN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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