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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002058`

染色体: Chr06 坐标: 27099141-27101398 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002058`
名称	SmilChr06G002058
描述	F-box protein At5g67140
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27099141 - 27101398 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988958`
GeneID	`130988958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988958`
原始查询	`LOC130988958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g67140
产物	F-box protein At5g67140
Arabidopsis	`AT5G67140` (AT5G67140) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836849] identity=69.9; qcov=0.962; evalue=2.28e-117; confidence=high
Rice	`Os06g0166000` (OsFbox298) - identity=61.3; qcov=0.868; evalue=2.6e-89; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768930.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768930.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057768930.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768930.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768930.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27099362`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B16
`Chr6:27099362`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B16
`Chr6:27100449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:27100762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D10
`Chr6:27100806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768930.1

235 aa

118

235

F-box-like

PF12937 F-box-like 15-48 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768930.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	15	48	2.5e-08	34.3	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912947.1
TTCCTTAGAAAATAATGGTTGTAGATTCTAAAGATGACGAAAAGATGACCACACTTTAACATTATTATGACTCTTCCATTTCTCTTTCCTTGTTGAAAAGCCTCATAACATTTCTCCACTTTTCGGAATTTTTTTTTGTGTGTATGAAAATAGAAATGAAGGGAAAAGGAGATGAAGAAGCCGATATTGATCGGCTGCCTGTAGATTTATTGGCACATATATTCTCTCTCTTCACTTCCTTCAAAGACTTGGCTCAGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988958
ATGAAAATAGAAATGAAGGGAAAAGGAGATGAAGAAGCCGATATTGATCGGCTGCCTGTAGATTTATTGGCACATATATTCTCTCTCTTCACTTCCTTCAAAGACTTGGCTCAGGGTAGCGGCGTGTGTAGAAAATGGAGGCAGGGAGTGATGGAATCTCTGGCTCGGAAGGAATCGCTGAGTTTCTCTGGCTGGAAAATGGACGACGACTCCACCACTCGACTCGTTCATCTAGCCTATAGCCTCAAGGAGCTCGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768930.1
MKIEMKGKGDEEADIDRLPVDLLAHIFSLFTSFKDLAQGSGVCRKWRQGVMESLARKESLSFSGWKMDDDSTTRLVHLAYSLKELDISRSRWGCQITDHGLKQLSTAKCIAKLSSISMWGSTGITDKGVVQMISRATSLHHLNIGGTFITDVSLFAIADSCPHLKTIVLWGCRHVTGDGLLALVNKCRKLESINVWGMRVPLDCFIGLLTISPALQIRPKGIVMHDETLHAWPVY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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