当前解析结果
SmilChr06G002062| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002062 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002062 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002062 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 27118047 - 27121274 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988960 |
|---|---|
| GeneID | 130988960 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988960 |
| 原始查询 | LOC130988960 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988960 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057768931.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057768931.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057768931.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768931.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768931.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:27118538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr6:27118541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C77 |
Chr6:27118541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:27118543 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B123,B35 |
Chr6:27118556 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr6:27118598 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 187 | A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B2,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B70,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B89,B91,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C65,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C81,C82,C84,C85,C9,D1,D3,D4,D5,D7,D8,D9 |
Chr6:27118599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B140 |
Chr6:27118599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr6:27118600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr6:27118605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr6:27118610 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C77 |
Chr6:27118610 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。