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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002093`

染色体: Chr06 坐标: 27823302-27832521 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002093`
名称	SmilChr06G002093
描述	uncharacterized SmilChr06G002093
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	27823302 - 27832521 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988978`
GeneID	`130988978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988978`
原始查询	`LOC130988978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ran-binding protein in the microtubule-organising centre protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836814]; symbol=AT5G66810; hit=AT5G66810; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ran-binding protein in the microtubule-organising centre protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836814]; symbol=AT5G66810; hit=AT5G66810; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G66810` (AT5G66810) Ran-binding protein in the microtubule-organising centre protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836814] identity=57.3; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0382300` - identity=53.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10607 (CTLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768950.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768950.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768950.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768950.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:27825538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:27825827`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr6:27825827`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr6:27826123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:27831989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:27832026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:27832091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C36,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768950.1

697 aa

348

697

CTLH

PF10607 CTLH 49-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768950.1`	Pfam	`PF10607`	CTLH	Domain	49	164	1.6e-23	84.2	CTLH/CRA C-terminal to LisH motif domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912967.1
ATCCATGGCTGGCAAATTCAACCATGGGTGAGCGCCGCCTTACTCTGCCAATTTTCACCCCCCAAATCCAAATCCAATCCTTCCCAAAAATCAAAATCCAAAAACCCTAACTATACATTTCAATTCTATCCATCTAAATTTAACATAAAGATCACGCCTTTGTCAATCGTCACGCGCGCGCGCACACACAGATATCTATATATATACTAGAGAAATGTTACAGTACACACACTCAATTCAGACGAAGCGCAGCGAATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988978
ATGGATTCGACGCCAGTAAATTGGGAGGCGCTGGATGCTCTCGTGATCGACTTCGCCAAGTCGGAGCGATTGATCGGTGACTCGCCGCCATCGCCGTCGCCGACTTCTCTGTCCTCCTCCTCTTACCGGTGGCGCCTCCTGATTTGCCAGATCAGGCGCTCCATTGAGTCCGGCGACATCGACTCCGCTATTGACCTCCTCCGAGGATACGCCCCCGCCGTGCTCGATGATCACCGCCTCCTCTTCCGTCTGCAGAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768950.1
MDSTPVNWEALDALVIDFAKSERLIGDSPPSPSPTSLSSSSYRWRLLICQIRRSIESGDIDSAIDLLRGYAPAVLDDHRLLFRLQKQKFIELLRKGTAGDRDSAIECARKSLAPCALDAYPEAYEEFKHALLAFIYDKDDQMSPVANEWSERRRFEIAGLLSSILRAHLQAYDPIFTMTLRYLISIHKGFCLHQGVSSPLANLTERLLLEERDPPATPQESLFEAPPFDEVDIQALAHAVELTRQGAIDSLRFAKGDLHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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