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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002102`

染色体: Chr06 坐标: 28074457-28078233 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002102`
名称	SmilChr06G002102
描述	uncharacterized membrane protein At3g27390
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	28074457 - 28078233 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988980`
GeneID	`130988980`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988980`
原始查询	`LOC130988980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829857]; symbol=AT4G37030; hit=AT4G37030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829857]; symbol=AT4G37030; hit=AT4G37030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G37030` (AT4G37030) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829857] identity=63.8; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0449500` - identity=63.2; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28741 (At3g27390_C); PF28744 (At3g27390_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988980

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057768952.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057768952.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057768952.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057768952.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:28075893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:28076254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:28076255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B65,B75,C49
`Chr6:28076618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:28076619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:28077879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:28077912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768952.1

589 aa

294

589

At3g27390_N

At3g27390_C

PF28744 At3g27390_N 17-270 aa PF28741 At3g27390_C 362-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768952.1`	Pfam	`PF28744`	At3g27390_N	Domain	17	270	1.3e-115	386.1	At3g27390, N-terminal domain
`XP_057768952.1`	Pfam	`PF28741`	At3g27390_C	Domain	362	544	1.1e-74	250.5	At3g27390, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912969.1
GATATCTGGGGACCCGACCCGTTGAATATTTCAAATTTTCAATATATATGGTGGCGTAGTTCTGATTGGTTTTTGACTTTCTCTGCTCTCCATTTCTGTCTTATTCTTGGAAACTTCTTCCTTTTCTTCCTCAAAATTATTTGGGTTCAGTTTTCAAAGTTTCTTGGAAGCTTTGTGTTTCGCCAATAAAAATTGCTTTACGGTTTTGATCAAGTTGATTCTCCACCTCAGCATGCCTACTAGCTTCAAAGATTGGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988980
ATGCCTACTAGCTTCAAAGATTGGCTCAAAACCTTCTATGTGGTCCTTGCCTTCTGTGCTGTGCTCTGCTTTGGCGCCCTTAAAAGTTTGCTCGTGGGCCCAGTTGCCGGTTTGATACTGATTTTGGGGAATTTAGGGGTGATTTTAGGCCTTTTCCCTGCACATGTTGCGTGGACGGTTTACACCCTTCTCAAAACACATAAGTTTGATGCGCCCCTCAAAGTTGCAATCTTGTTGGGGTTGCCTGCTTTATTTGGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768952.1
MPTSFKDWLKTFYVVLAFCAVLCFGALKSLLVGPVAGLILILGNLGVILGLFPAHVAWTVYTLLKTHKFDAPLKVAILLGLPALFGLWLGLSIAGSCLVGVGYGFFTPWVSSFEAFRLEDESKKFYHCLVDGTWGVIKGSCTVVRDFADLCYHSYPNYLKELRENPASNELQPLRFIHVPACIIVGLMGLIVEIPLYTAIAIVKSPFMLFKGWQRLLHDLISREGPFLETACIPIAGLAIIMWPLVVVGSILLAIFTSFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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