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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002140`

染色体: Chr06 坐标: 29057439-29062826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002140`
名称	SmilChr06G002140
描述	uridylate kinase PUMPKIN, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29057439 - 29062826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989017`
GeneID	`130989017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989017`
原始查询	`LOC130989017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uridylate kinase PUMPKIN, chloroplastic
产物	uridylate kinase PUMPKIN%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G18680` (AT3G18680) Amino acid kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821399] identity=83.8; qcov=0.985; evalue=1.44e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0965400` (YGL8) - identity=85.3; qcov=0.955; evalue=5.23e-161; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006225 (UDP biosynthetic process); GO:0033862 (UMP kinase activity)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00696 (AA_kinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768996.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768998.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057768996.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768998.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29060918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:29061826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B127,C47,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768996.1

329 aa

164

329

AA_kinase

PF00696 AA_kinase 89-298 aa

XP_057768997.1

329 aa

164

329

AA_kinase

PF00696 AA_kinase 89-298 aa

XP_057768998.1

264 aa

132

264

AA_kinase

PF00696 AA_kinase 24-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768996.1`	Pfam	`PF00696`	AA_kinase	Family	89	298	7.9e-36	124.7	Amino acid kinase family
`XP_057768997.1`	Pfam	`PF00696`	AA_kinase	Family	89	298	7.9e-36	124.7	Amino acid kinase family
`XP_057768998.1`	Pfam	`PF00696`	AA_kinase	Family	24	233	4.1e-36	125.6	Amino acid kinase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913014.1
GAAGTCGGAACCCACTACCTCTTGGGGAAGTGAAGGAACCACAATAATTGGCTAATTGCCATTGCACCATATAACAGATTTGGGTTTTAGTTATCAAAATTTTTAATATAGACCTACTCTTTGAGCAAAGATATTTTTGGGGAAGTATTTGTAGTATTTCCCAAACAACATTATCCAACACAAAAATCTCAAGGAAAAGACCAACACCTAAACCCTCTTCGTCTCAAAATGAATACTCATTCAAACAAACTGTAATTGAA...

XM_057913013.1
TTTAGTTATCAAAATTTTTAATATAGACCTACTCTTTGAGCAAAGATATTTTTGGGGAAGTATTTGTAGTATTTCCCAAACAACATTATCCAACACAAAAATCTCAAGGAAAAGACCAACACCTAAACCCTCTTCGTCTCAAAATGAATACTCATTCAAACAAACTAGAATGGTGATTCCGACCACTTTCAGCCGCCCAATTAGCTCTTTCAATGCCATCACTTCGCCCTCTTTCTGTTTCTTGAGGCCTAACTTCGCTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989017
ATGGTGATTCCGACCACTTTCAGCCGCCCAATTAGCTCTTTCAATGCCATCACTTCGCCCTCTTTCTGTTTCTTGAGGCCTAACTTCGCTTCTCAAAACAATGCGGCCAACTCTTACAGTTATCAGCGTCTGGTTATTAGTTGTTGTGCTGCTGAAGAGGATTCCCTGAATTTGAGGCAACCACAGATTTCATCTATGCCTATGCCTCCTTATAGTGTGGCAATGAATGGTAGTAGCAAACAGAAAACCACATATAGATG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057768996.1
MVIPTTFSRPISSFNAITSPSFCFLRPNFASQNNAANSYSYQRLVISCCAAEEDSLNLRQPQISSMPMPPYSVAMNGSSKQKTTYRWRRVLLKVSGEALAGDRTQNIDPKITMSIAREVASVTRLGIEVAIVVGGGNIFRGASWTGSSGLDRSSADYIGMLATVMNAIFLQATMESIGIPTRVQTAFRMSEVAEPYIRRRAVRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRSAEINAEVVLKATNVDGVYDDDPRFNPNA...

XP_057768997.1
MVIPTTFSRPISSFNAITSPSFCFLRPNFASQNNAANSYSYQRLVISCCAAEEDSLNLRQPQISSMPMPPYSVAMNGSSKQKTTYRWRRVLLKVSGEALAGDRTQNIDPKITMSIAREVASVTRLGIEVAIVVGGGNIFRGASWTGSSGLDRSSADYIGMLATVMNAIFLQATMESIGIPTRVQTAFRMSEVAEPYIRRRAVRHLEKGRVVIFAAGTGNPFFTTDTAAALRSAEINAEVVLKATNVDGVYDDDPRFNPNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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