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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002149`

染色体: Chr06 坐标: 29203562-29207885 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002149`
名称	SmilChr06G002149
描述	transcription factor TCP13-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	29203562 - 29207885 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989022`
GeneID	`130989022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989022`
原始查询	`LOC130989022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP13-like
产物	transcription factor TCP13-like
Arabidopsis	`AT3G02150` (PTF1) plastid transcription factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821061] identity=57.9; qcov=0.502; evalue=4.73e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0763200` (OsTCP5) - identity=71.9; qcov=0.303; evalue=4.37e-42; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769001.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769001.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769002.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769002.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:29203720`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B11,B26,B35,B41,B57,B73,B80,B89,C40,C51,C74,C77,D4
`Chr6:29204259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:29204483`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B134
`Chr6:29204483`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B134
`Chr6:29204489`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,B11,B123,B24,B26,B35,B41,B44,B75,B78,B80,B89,B99,C3,C30,C40,C47,C51,C74,C75,C77,C85,D1,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769001.1

327 aa

164

327

TCP

PF03634 TCP 101-255 aa

XP_057769002.1

317 aa

158

317

TCP

PF03634 TCP 91-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769001.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	101	255	5.1e-29	102.6	TCP family transcription factor
`XP_057769002.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	91	245	9.2e-29	101.7	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913019.1
GAATTGTAATTGAGAATTTGATAAGATTTTGATTGTGCCCCAAATACACGTGGCTGCGTCTCCGCCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTGTGATGGGGCTTGGTCGGCTCACCCATGTATCTACTTTTGTACTAATTAACACTCCTCTTGCATTGCATATAGTACTCTCATACTCTAAGCTTTTCCAATGTCAATTCCAGTCTGCTTTTCTCCAAACTAAACAGGTATATATATACATATATGAGATCACAGCACACAATCCGA...

XM_057913018.1
ATTGTAATTGAGAATTTGATAAGATTTTGATTGTGCCCCAAATACACGTGGCTGCGTCTCCGCCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTGTGATGGGGCTTGGTCGGCTCACCCATGTATCTACTTTTGTACTAATTAACACTCCTCTTGCATTGCATATAGTACTCTCATACTCTAAGCTTTTCCAATGTCAATTCCAGTCTGCTTTTCTCCAAACTGTAAGAAATCTCCTGTCTTCACATCTACATAAACAGGTATATATATAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989022
ATGGGGCTTGGTCGGCTCACCCATGTATCTACTTTTGTACTAATTAACACTCCTCTTGCATTGCATATAGTACTCTCATACTCTAAGCTTTTCCAATGTCAATTCCAGTCTGCTTTTCTCCAAACTGTAAGAAATCTCCTGTCTTCACATCTACATAAACAGGTATATATATACATATATGAGATCACAGCACACAATCCGAAGATGATTCCAAAGGAGCAGGCGAAGCAAGAGAGCTCATCAACAACATGGTCGAGATT...

LOC130989022
ATGGGGCTTGGTCGGCTCACCCATGTATCTACTTTTGTACTAATTAACACTCCTCTTGCATTGCATATAGTACTCTCATACTCTAAGCTTTTCCAATGTCAATTCCAGTCTGCTTTTCTCCAAACTAAACAGGTATATATATACATATATGAGATCACAGCACACAATCCGAAGATGATTCCAAAGGAGCAGGCGAAGCAAGAGAGCTCATCAACAACATGGTCGAGATTGAAGGATCCTCGGATAGTCCGAGTGTCGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769001.1
MGLGRLTHVSTFVLINTPLALHIVLSYSKLFQCQFQSAFLQTVRNLLSSHLHKQVYIYIYEITAHNPKMIPKEQAKQESSSTTWSRLKDPRIVRVSRAMGGKDRHSKVCTVRGLRDRRVRLSVPTAIQLYDLQDRLGLNQPSKVVDWLLDAAKNEIDELPPLQIPQGICFSQMLNPNTTNQKHLLSTSTSTHRSEEDEEEEENPSSFASLMSSSASYGRWDPSISLGLAATAHHQHGDFVSHQHQHQHQHQHQHQHQHQH...

XP_057769002.1
MGLGRLTHVSTFVLINTPLALHIVLSYSKLFQCQFQSAFLQTKQVYIYIYEITAHNPKMIPKEQAKQESSSTTWSRLKDPRIVRVSRAMGGKDRHSKVCTVRGLRDRRVRLSVPTAIQLYDLQDRLGLNQPSKVVDWLLDAAKNEIDELPPLQIPQGICFSQMLNPNTTNQKHLLSTSTSTHRSEEDEEEEENPSSFASLMSSSASYGRWDPSISLGLAATAHHQHGDFVSHQHQHQHQHQHQHQHQHQHQLLVYQSAQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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