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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002181`

染色体: Chr06 坐标: 30043642-30044938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002181`
名称	SmilChr06G002181
描述	uncharacterized SmilChr06G002181
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	30043642 - 30044938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989044`
GeneID	`130989044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989044`
原始查询	`LOC130989044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0639700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0639700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0639700` - identity=31.9; qcov=0.46; evalue=7.86e-06; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769021.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769021.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769021.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769021.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:30044402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:30044422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:30044431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr6:30044456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr6:30044578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769021.1

198 aa

198

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 67-189 aa

XP_057769022.1

198 aa

198

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 67-189 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769021.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	67	189	1.3e-10	42.3	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057769022.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	67	189	1.3e-10	42.3	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913038.1
TTTGATGACATTCATCATATGTGTGAATTGGAGGCTCTCGCAGCATCGTGCATATGTATGTACATGTGGTACTTATACAAGGAATATGAGAATTCAGGCATTCTTGATACAATTCGATTTGTTGATCCATATGATATATCACACAATCCTAATGTTGCCCAAGCTAAAAAAGCGAGTATTGTAGGCCAGAGGTTGATTGGTACCAAAACTGATCAACTTGTTTTATTGCCATGTAACGTAGGTTGGCATTGGGTCCTCAT...

XM_057913039.1
TTTGATGACATTCATCATATGTGTGAATTGGAGGCTCTCGCAGCATCGTGCATATGTATGTACATGTGGTACTTATACAAGGAATATGAGAATTCAGGCATTCTTGATACAATTCGATTTGTTGATCCATATGATATATCACACAATCCTAATGTTGCCCAAGCTAAAAAAGCGAGTATTGTAGGCCAGAGGTTGATTGGTACCAAAACTGATCAACTTGTTTTATTGCCATGTAACGTAGGTTGGCATTGGGTCCTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989044
ATGTGTGAATTGGAGGCTCTCGCAGCATCGTGCATATGTATGTACATGTGGTACTTATACAAGGAATATGAGAATTCAGGCATTCTTGATACAATTCGATTTGTTGATCCATATGATATATCACACAATCCTAATGTTGCCCAAGCTAAAAAAGCGAGTATTGTAGGCCAGAGGTTGATTGGTACCAAAACTGATCAACTTGTTTTATTGCCATGTAACGTAGGTTGGCATTGGGTCCTCATGATGGTCTATCCCCATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769021.1
MCELEALAASCICMYMWYLYKEYENSGILDTIRFVDPYDISHNPNVAQAKKASIVGQRLIGTKTDQLVLLPCNVGWHWVLMMVYPHKETVYVLDPLTDSFHVEEWKSIMTTAIKMFNMSIGVRGSQNLLWEVIDSPQQPDGKQCGFYVMRYMRDVIDNIVSDHSLSITTLFAGGCYSKKEIDEVRIEWAEFVCKITDE

XP_057769022.1
MCELEALAASCICMYMWYLYKEYENSGILDTIRFVDPYDISHNPNVAQAKKASIVGQRLIGTKTDQLVLLPCNVGWHWVLMMVYPHKETVYVLDPLTDSFHVEEWKSIMTTAIKMFNMSIGVRGSQNLLWEVIDSPQQPDGKQCGFYVMRYMRDVIDNIVSDHSLSITTLFAGGCYSKKEIDEVRIEWAEFVCKITDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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