当前解析结果
SmilChr06G002212| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002212 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002212 |
| 描述 | protein E6 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 30884881 - 30885931 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989069 |
|---|---|
| GeneID | 130989069 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989069 |
| 原始查询 | LOC130989069 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein E6 |
| 产物 | protein E6 |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989069 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.80000 | XP_057769025.1 |
| 2 | Cell wall | 细胞壁 | 0.20000 | XP_057769025.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769025.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769025.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057769025.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:30884976 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 79 | A11,A14,A15,A19,A21,A24,B10,B101,B102,B108,B109,B11,B112,B115,B117,B120,B122,B126,B132,B138,B139,B14,B140,B17,B19,B20,B22,B25,B28,B3,B32,B33,B35,B36,B40,B41,B45,B46,B52,B53,B58,B66,B67,B69,B71,B72,B73,B76,B8,B89,B9,B94,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C17,C21,C27,C3,C31,C33,C39,C41,C42,C48,C51,C52,C55,C56,C58,C65,C69,C70,C79,C82,D7 |
Chr6:30885039 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B16,C35,C64,C66 |
Chr6:30885126 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr6:30885372 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr6:30885383 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
Chr6:30885399 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,A4,B51,B73 |
Chr6:30885417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr6:30885492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,D11 |
Chr6:30885505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr6:30885513 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr6:30885591 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C52 |
Chr6:30885636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B133,B52,B53,B64,C6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。