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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002349`

染色体: Chr06 坐标: 34168033-34171287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002349`
名称	SmilChr06G002349
描述	amino acid permease 3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34168033 - 34171287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989170`
GeneID	`130989170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989170`
原始查询	`LOC130989170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid permease 3-like
产物	amino acid permease 3-like
Arabidopsis	`AT1G77380` (AAP3) amino acid permease 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844074] identity=79.3; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0195600` (OsAAP11C) - identity=75.9; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769092.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769092.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057769092.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769092.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34168380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr6:34168398`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A10,A23,A8,B101,B103,B105,B120,B14,B29,B38,B56,B72,B83,B9,C10,C11,C13,C16,C43,C46,C54,C59,C65,C68,C80,C9,D3
`Chr6:34168401`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	26	A10,A23,A8,B101,B105,B120,B14,B29,B38,B56,B72,B83,B9,C10,C11,C13,C16,C43,C46,C54,C59,C65,C68,C80,C9,D3
`Chr6:34168406`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A10,A23,A8,B101,B105,B120,B14,B29,B38,B56,B72,B83,B9,C10,C11,C13,C43,C46,C54,C59,C65,C68,C80,C9
`Chr6:34168407`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A23,A8,B101,B105,B120,B14,B29,B38,B56,B72,B83,B9,C10,C11,C13,C43,C46,C54,C59,C65,C68,C80
`Chr6:34168422`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,A23,A8,B101,B105,B120,B14,B29,B38,B56,B72,B78,B83,B9,C10,C11,C13,C16,C43,C46,C54,C59,C65,C68,C80
`Chr6:34168458`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B83,C54,C59
`Chr6:34168458`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B83,C54,C59
`Chr6:34168475`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C54
`Chr6:34168475`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C54
`Chr6:34168476`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr6:34168476`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769092.1

481 aa

240

481

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 40-468 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769092.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	40	468	5.1e-120	401.6	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913109.1
AAAATGTTTACACACCAAAAATTTTCCTCTATATAAGCTGCACAAGCACAGAACAAATTGTGTGCAGCAGTTGCTTTCCCATCATATATTTGTCAAATAATTCCCTCTTTGTATATAGTTTTTGTTCCTCTGTTTGAGGGAGCTAGAGGACTTCCCAACAATAATCAAGGATGGGAGAGGGCACTGCCACCAACAACCACCACCACAGCGCCCAAGTGTTCGACGTCTCCGTCAATATGACACCACATTGCGGCTCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989170
ATGGGAGAGGGCACTGCCACCAACAACCACCACCACAGCGCCCAAGTGTTCGACGTCTCCGTCAATATGACACCACATTGCGGCTCCAAAGCAGTTGATGACGACGGCCGGCCCCAAAGAACTGGGAGTGTGTGGACAGCGAGTGCACACATCATAACGGCGGTGATTGGGTCGGGAGTTCTGTCGTTGGCATGGGCTATAGGTCAGCTGGGATGGATTGCTGGGCCATCTGTCATGCTGCTCTTCTCCTTGGTCATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769092.1
MGEGTATNNHHHSAQVFDVSVNMTPHCGSKAVDDDGRPQRTGSVWTASAHIITAVIGSGVLSLAWAIGQLGWIAGPSVMLLFSLVIYYTSTLLADCYRSGDPLFGKRNYTYMDAVRSNLGGSKVKLCGTIQYLNIFGVAVGYTIASSISMMAIKRSNCFHKSDGKDPCHMSSNPYMIAFGVTQILFSQIPDFDQIWWLSIVAAIMSFTYSSIGLGLGVAQTLANGGIKGSLTGISIGAVTETQKIWRSFQALGDIAFAYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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