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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002358`

染色体: Chr06 坐标: 34376447-34381361 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002358`
名称	SmilChr06G002358
描述	uncharacterized SmilChr06G002358
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34376447 - 34381361 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989175`
GeneID	`130989175`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989175`
原始查询	`LOC130989175`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989175

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769096.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057769096.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34376879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr6:34377103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr6:34377312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B90,C31,D9
`Chr6:34377427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr6:34377431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B110
`Chr6:34377434`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A22,B120,B18,B41,B60,B72,B8,B82,B83,B85,B91,B92,B95,C21,C37,C54,C63,C77,C83,C84
`Chr6:34377566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C54
`Chr6:34377692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr6:34377732`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A13,A22,A4,B100,B103,B120,B125,B14,B17,B18,B30,B41,B6,B60,B63,B72,B8,B82,B83,B85,B86,B90,B91,B93,B95,B97,C12,C13,C14,C18,C21,C37,C4,C52,C54,C63,C70,C73,C79,C83,C84,D6
`Chr6:34377786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:34378018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:34378138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769096.1

369 aa

184

369

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 267-366 aa

XP_057769097.1

345 aa

172

345

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 243-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769096.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	267	366	2.9e-05	24.7	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain
`XP_057769097.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	243	342	2.5e-05	24.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090519.1
GAAGAATCGTCATCTGCTCGTGTAGCAAAGAAGAAAAAGATCGGCGAAACATCAGGAGTGAAAAATATGGAAGATGAACCAAAGAGAAAGAGGGGTAAAAAAAGTTATTTGTAAATCCAAAGAATGTCAAATGTAGAAGACGCGTTCTGTAGAACAAAAATGGTGTTCAACCGAAGGAAAAAGCAGACCATCCGAAGTTGAAGACGCGTACAACAACTAGAGCTTTCTTCAAAAAATTGGCTGAATTGAACGATGCCCAA...

XR_009090520.1
GAAGAATCGTCATCTGCTCGTGTAGCAAAGAAGAAAAAGATCGGCGAAACATCAGGAGTGAAAAATATGGAAGATGAACCAAAGAGAAAGAGGGGTAAAAAAAGTTATTTGTAAATCCAAAGAATGTCAAATGTAGAAGACGCGTTCTGTAGAACAAAAATGGTGTTCAACCGAAGGAAAAAGCAGACCATCCGAAGTTGAAGACGCGTACAACAACTAGAGCTTTCTTCAAAAAATTGGCTGAATTGAACGATGCCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989175
ATGTTGTGGGCAAGACTATCGCGACAGAAAAGCATAGTTGGTGAAACTGAAATTGCCGTTAGTAAGGAGACGATGGTTCAAAGTGTAAGGGGTCAGCTAGATGGTTCAACCATGAATGAGGTTTTAATGGATGCTGCAACTGGAAGTGAAAAGGTTCAAGGCGACGATGTTAGTGGCGCTACCGTTGTTAGGCAGGAGGTCAGACGTTCTAACAGGGTTAAGGGGATCCAGGTGGGTGATGCCGGGAAGCAGGTGCTTCG...

LOC130989175
ATGGTTCAAAGTGTAAGGGGTCAGCTAGATGGTTCAACCATGAATGAGGTTTTAATGGATGCTGCAACTGGAAGTGAAAAGGTTCAAGGCGACGATGTTAGTGGCGCTACCGTTGTTAGGCAGGAGGTCAGACGTTCTAACAGGGTTAAGGGGATCCAGGTGGGTGATGCCGGGAAGCAGGTGCTTCGTCCTACCACAACAAAGACAGGGGTTGACGAGAACTCCAAAACAATAGTTGTGGTGGATCGGTTACCGTTACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769096.1
MLWARLSRQKSIVGETEIAVSKETMVQSVRGQLDGSTMNEVLMDAATGSEKVQGDDVSGATVVRQEVRRSNRVKGIQVGDAGKQVLRPTTTKTGVDENSKTIVVVDRLPLQAIDTNIISPERRETKATGKSMFLHTLKFRSPYFQCDISTSKPLKKNEKELGFYAMYLDSGENKEILFELMDIQVRRFELLSMRRGNVVNISIIDAWTLVLNWKEQYRSNSSPLRFFSTASLYLDSIAPQNLSLESQRAKFLMELYVELI...

XP_057769097.1
MVQSVRGQLDGSTMNEVLMDAATGSEKVQGDDVSGATVVRQEVRRSNRVKGIQVGDAGKQVLRPTTTKTGVDENSKTIVVVDRLPLQAIDTNIISPERRETKATGKSMFLHTLKFRSPYFQCDISTSKPLKKNEKELGFYAMYLDSGENKEILFELMDIQVRRFELLSMRRGNVVNISIIDAWTLVLNWKEQYRSNSSPLRFFSTASLYLDSIAPQNLSLESQRAKFLMELYVELIEFGKNPVGNIDMFFFPVYEQERYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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