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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002374`

染色体: Chr06 坐标: 34593052-34596486 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002374`
名称	SmilChr06G002374
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 65 kDa protein
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34593052 - 34596486 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989193`
GeneID	`130989193`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989193`
原始查询	`LOC130989193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 65 kDa protein
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 65 kDa protein
Arabidopsis	`AT1G09230` (AT1G09230) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837443] identity=58.8; qcov=0.945; evalue=2.74e-156; confidence=high
Rice	`Os03g0326600` - identity=59.9; qcov=0.942; evalue=4.63e-161; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0030626 (U12 snRNA binding); GO:0097157 (pre-mRNA intronic binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989193

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769114.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057769114.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769114.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769114.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34593471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B137,B55,C2
`Chr6:34593477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:34594588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,D3
`Chr6:34594657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr6:34595014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D10
`Chr6:34595345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:34595358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34596190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B32,B39,C37,C42,C46,C61,C8,C80,D11,D5
`Chr6:34596299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B126,B40,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769114.1

452 aa

226

452

RRM_1

PF00076 RRM_1 27-92 aa PF00076 RRM_1 364-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769114.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	27	92	6.3e-22	78.0	RNA recognition motif
`XP_057769114.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	364	437	6.3e-22	78.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913131.1
GATTTCTTTACCCTCCTAATCATTAATCACACGACCTAAAAAAATTATTCAAACAAAAGATATCGATTTTTGATAAATTAAAAAATTACATCTTGTAAACCTTACATCCCAAAGGATTGAGGAGCAGGATTTTAAGTAAGAATTTCAGAGTGTTGTTGATCACTGAGAAGATTATTGGGAGGAGAGAGTGTCAATTCTTTCCCCAGTGGGAGAGGAAGCCCAGAATCCAAGTTCAAAAATTTCCACCACTGAAGCAAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989193
ATGGCGGAGGCGCCGCAGCCGATGACCCATCAATTAATGTGGAATTCCGGCGAGGAGTCATCGTCATCGGCAGCTACGCTGCTGGTTCGGCATCTCCCGGAGGCCATTCCTCACGATACTCTTACCCGACTCTTTTCTCACTACGGCGCCTCTTCTGTCCGCCCCTTTTCTCATGGACGGGTGAAAAATTGCGCTTTTGTTGATTTCAAGGATGGAATGTCAGCATACCAAGCCCAGAAGCAGCTACATGGGTTACGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769114.1
MAEAPQPMTHQLMWNSGEESSSSAATLLVRHLPEAIPHDTLTRLFSHYGASSVRPFSHGRVKNCAFVDFKDGMSAYQAQKQLHGLRFLGKVMSVERASKVVEGTKQQDNEREVRKDASSMVKDASAPSHHYTGSISHASEPIAQKLGIEYPFPPHLEYAYPPPDGNILTNIVNALIAVPRFYTQVLHLMNKMNIPAPFRKALPTPPLPEFPSAPPPPPPPPMESNMEYLSSSESEMESSDEEVGREARPNRKRARRQAIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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