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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002384`

染色体: Chr06 坐标: 34657358-34659829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002384`
名称	SmilChr06G002384
描述	isocitrate dehydrogenase [NAD] regulatory subunit 1, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34657358 - 34659829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989204`
GeneID	`130989204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989204`
原始查询	`LOC130989204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isocitrate dehydrogenase [NAD] regulatory subunit 1, mitochondrial-like
产物	isocitrate dehydrogenase [NAD] regulatory subunit 1%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G35260` (IDH1) isocitrate dehydrogenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829679] identity=82.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0595500` (OsIDHc) - identity=82; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004449 (isocitrate dehydrogenase (NAD+) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006102 (isocitrate metabolic process)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00180 (Iso_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057769138.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057769138.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769138.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769138.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34657494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34657528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:34657530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:34657680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C62
`Chr6:34657803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769138.1

365 aa

182

365

Iso_dh

PF00180 Iso_dh 38-360 aa

XP_057769139.1

361 aa

180

361

Iso_dh

PF00180 Iso_dh 38-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769138.1`	Pfam	`PF00180`	Iso_dh	Domain	38	360	2.8e-78	264.4	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase
`XP_057769139.1`	Pfam	`PF00180`	Iso_dh	Domain	38	356	7.3e-75	253.1	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913155.1
GCTCTTTCCTACTTCACTTTTCCATGAAACTCCATCTCCACCTCCGCCACCTCAATAACACGATCCAACCCTAATTCCACTCTCAATTTCCGATTTCCCCTCCATTCCGATCGATCAACATGTCCCGGCGCGCGCTCCCGATCGTCAGGGATCTCCTCTCCGCCCGATCCGCGACGGCGACGCGATCCGTCACCTACATGCCCCGCCCCGGCGACGGATCCCCCCGCCCCGTCACTCTGATCCCGGGCGACGGCGTCGGC...

XM_057913156.1
GCTCTTTCCTACTTCACTTTTCCATGAAACTCCATCTCCACCTCCGCCACCTCAATAACACGATCCAACCCTAATTCCACTCTCAATTTCCGATTTCCCCTCCATTCCGATCGATCAACATGTCCCGGCGCGCGCTCCCGATCGTCAGGGATCTCCTCTCCGCCCGATCCGCGACGGCGACGCGATCCGTCACCTACATGCCCCGCCCCGGCGACGGATCCCCCCGCCCCGTCACTCTGATCCCGGGCGACGGCGTCGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989204
ATGTCCCGGCGCGCGCTCCCGATCGTCAGGGATCTCCTCTCCGCCCGATCCGCGACGGCGACGCGATCCGTCACCTACATGCCCCGCCCCGGCGACGGATCCCCCCGCCCCGTCACTCTGATCCCGGGCGACGGCGTCGGCCCGCTCGTCACCGGCGCGGTCGAACAGGTCATGGAGGCGATGCACGCTCCCGTGTATTTCGAGAAGTTCGACGTGCAAGGCGACATGAAGAGCGTGCCGCTGGAGGTGCTCGAATCGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769138.1
MSRRALPIVRDLLSARSATATRSVTYMPRPGDGSPRPVTLIPGDGVGPLVTGAVEQVMEAMHAPVYFEKFDVQGDMKSVPLEVLESIKKNKVCLKGGLRTPVGGGVNSLNMILRKELDLYASLVHCFNLPGLPTRHDNVDIVVIRENTEGEYSGLEHEVIPGVVESLKVITKFCSERIAKYAFEYAYLNNRKKVTAVHKANIMKLADGLFLESCREVASHYPGIQYNEMIVDNCSMQLVSKPEQFDVMVTPNLYGNLVAN...

XP_057769139.1
MSRRALPIVRDLLSARSATATRSVTYMPRPGDGSPRPVTLIPGDGVGPLVTGAVEQVMEAMHAPVYFEKFDVQGDMKSVPLEVLESIKKNKVCLKGGLRTPVGGGVNSLNMILRKELDLYASLVHCFNLPGLPTRHDNVDIVVIRENTEGEYSGLEHEVIPGVVESLKFCSERIAKYAFEYAYLNNRKKVTAVHKANIMKLADGLFLESCREVASHYPGIQYNEMIVDNCSMQLVSKPEQFDVMVTPNLYGNLVANTAAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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