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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002387`

染色体: Chr06 坐标: 34681263-34684019 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002387`
名称	SmilChr06G002387
描述	O-fucosyltransferase 6
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34681263 - 34684019 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989206`
GeneID	`130989206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989206`
原始查询	`LOC130989206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-fucosyltransferase 6
产物	O-fucosyltransferase 6
Arabidopsis	`AT1G20550` (AT1G20550) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838643] identity=60.4; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0563000` - identity=59.5; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769141.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057769141.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769141.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769141.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34681641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr6:34681657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:34682145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:34682345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B16,C48
`Chr6:34682365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr6:34682365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:34682526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:34682957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:34682991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A13,A22,B121,B47,B61,B81,C9
`Chr6:34683161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B59
`Chr6:34683223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B43,D7
`Chr6:34683593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769141.1

602 aa

301

602

O-FucT

PF10250 O-FucT 136-478 aa

XP_057769142.1

600 aa

300

600

O-FucT

PF10250 O-FucT 134-476 aa

XP_057769143.1

575 aa

288

575

O-FucT

PF10250 O-FucT 136-451 aa

XP_057769144.1

573 aa

286

573

O-FucT

PF10250 O-FucT 134-449 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769141.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	136	478	3.8e-97	326.7	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057769142.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	134	476	3.7e-97	326.8	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057769143.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	136	451	9.2e-99	332.1	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase
`XP_057769144.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	134	449	9e-99	332.1	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913158.1
AACATTTGACATTGTCGTTGGTGCCGGTAATTTCAGTAGACAACCGAAACTCTTGCGATTTTTGGAGTTGTTGTTGCAGATCAGAAATCCTCCGCATTTCCTCACCACACCAGACCTCGTCAATCCCATCTCCTCACTCTTTCTCTCTCTAAACCACTACAACAACACCATTTCCGAATTCATTCTCTCTCCATCTCCGCGGAATGAGCATGATTAAGAAGAAAGCGCACAGAGACGAGCTGATCGGCCTCCAGATTCTA...

XM_057913159.1
AACATTTGACATTGTCGTTGGTGCCGGTAATTTCAGTAGACAACCGAAACTCTTGCGATTTTTGGAGTTGTTGTTGCAGATCAGAAATCCTCCGCATTTCCTCACCACACCAGACCTCGTCAATCCCATCTCCTCACTCTTTCTCTCTCTAAACCACTACAACAACACCATTTCCGAATTCATTCTCTCTCCATCTCCGCGGAATGAGCATGATTAAGAAGAAAGCGCACAGAGACGAGCTGATCGGCCTCCAGATTCTA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130989206
ATGAGCATGATTAAGAAGAAAGCGCACAGAGACGAGCTGATCGGCCTCCAGATTCTACACGGCCTCGTATTCCGCCACCACAGCCGCCGCCGCCTCCACCGCCTCCTCCCTCTCTTCTCCGCCGTCTCCGGCTGTCTGCTCCTCCTCTTCGCCGTCGTCCTCTTCCTCTCGCCTCCCGTCTCCGACCAAACCGCCCACCGCCGCCTCACTCTCAGTACATCGTTCAAAAACAAAGCCGGAATCCACATTAATGCCGAGAG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057769141.1
MSMIKKKAHRDELIGLQILHGLVFRHHSRRRLHRLLPLFSAVSGCLLLLFAVVLFLSPPVSDQTAHRRLTLSTSFKNKAGIHINAERENVFRVPRSGGIIDDRVVWTSNQSNFFFGCSNASEKFRPAEMSTEPRRYLLIATSGGLNQQRTGIVDAVVSAYILNATLVVPKLDQKSFWKDASNFSEIFNVEWFIKYLARDVRIVPQLPETAGKVITTRAPRKCNKKCYETRILPIYHRKRVCACLFLHFTSLDCVNAECFL...

XP_057769142.1
MSMIKKKAHRDELIGLQILHGLVFRHHSRRRLHRLLPLFSAVSGCLLLLFAVVLFLSPPVSDQTAHRRLTLSTSFKNKAGIHINAERENVFRVPRSGGIIDDRVVWTSNQSNFFFGCSNASEKFRQMSTEPRRYLLIATSGGLNQQRTGIVDAVVSAYILNATLVVPKLDQKSFWKDASNFSEIFNVEWFIKYLARDVRIVPQLPETAGKVITTRAPRKCNKKCYETRILPIYHRKRVCACLFLHFTSLDCVNAECFLVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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