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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002425`

染色体: Chr06 坐标: 34989919-34991760 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002425`
名称	SmilChr06G002425
描述	GDSL esterase/lipase At5g55050-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	34989919 - 34991760 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989232`
GeneID	`130989232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989232`
原始查询	`LOC130989232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At5g55050-like
产物	GDSL esterase/lipase At5g55050-like
Arabidopsis	`AT1G71250` (AT1G71250) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843466] identity=37; qcov=1.02; evalue=5.09e-70; confidence=medium
Rice	`Os02g0669000` (OsGELP42) - identity=46.1; qcov=0.937; evalue=5.22e-103; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057769166.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057769166.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057769166.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769166.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:34990114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B139,B32,C4
`Chr6:34990229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:34990236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:34990473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C27,C63,D3
`Chr6:34990644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:34990646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B77,C19
`Chr6:34990739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr6:34990973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34991126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:34991323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:34991375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B32,C4,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769166.1

366 aa

183

366

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 31-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769166.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	31	343	2.9e-32	113.2	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913183.1
ACACCAGTTCTTGATTTCCCTCAGTTGTCTCATGTGCATATATCAACTCTTATATAAATTGCCACTTTTTCAACTGAAAAAATTAAGACCATTTTGAGCTGCACATTTTGTGATGGCTAAGGCACACATTTCTCTACTCCTTTGTGTTTCTGTCGTCTTGCTCAATGTCGTCTCTCACTCAGCTGATGAGGCGTCGCCTGCCATTTTCGTACTAGGTGACTCGACTGCAGATGTTGGGACGAACCAGTACCTGCCTGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989232
ATGGCTAAGGCACACATTTCTCTACTCCTTTGTGTTTCTGTCGTCTTGCTCAATGTCGTCTCTCACTCAGCTGATGAGGCGTCGCCTGCCATTTTCGTACTAGGTGACTCGACTGCAGATGTTGGGACGAACCAGTACCTGCCTGAGACCATTTTCAGAGCTGATTTCCCTCCCTATGGCATAGACTTCCCCCATTCGCGCCCAACGGGAAGGTTTAGCAATGGCTTCAACAGTGCAGATTTTGTAGCCAAGCTCTTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769166.1
MAKAHISLLLCVSVVLLNVVSHSADEASPAIFVLGDSTADVGTNQYLPETIFRADFPPYGIDFPHSRPTGRFSNGFNSADFVAKLFGLKRSPPPYMYLLTLNPHHFRKHLLRGANFASAGAGILDITGPNGSVVPLSQQISQVSEVKGNLTLQIGSAAADSKLSRSMFFISVGSNDIFGYFKANSTMQKNKFIAIVISTYSDHIMKLYKLGARKFGIISVPPVGCCPSQRLVQKALYGADGCFELQNDFALTFHSALDTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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