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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002432`

染色体: Chr06 坐标: 35081542-35082730 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002432`
名称	SmilChr06G002432
描述	uncharacterized SmilChr06G002432
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35081542 - 35082730 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989240`
GeneID	`130989240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989240`
原始查询	`LOC130989240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0142200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0142200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G34412` (AT4G34412) EKC/KEOPS complex subunit tprkb-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829592] identity=71.3; qcov=1; evalue=1.17e-70; confidence=high
Rice	`Os01g0142200` - identity=73.4; qcov=1; evalue=1e-73; confidence=high
GO	GO:0000408 (EKC/KEOPS complex); GO:0000722 (telomere maintenance via recombination); GO:0002949 (tRNA threonylcarbamoyladenosine modification); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF08617 (CGI-121)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057769174.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057769174.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057769174.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057769174.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35081871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:35081872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B59,B90
`Chr6:35081878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:35081896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C5
`Chr6:35082041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B98,C48
`Chr6:35082319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B62
`Chr6:35082429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:35082449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:35082462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C48,C5,C51,C74
`Chr6:35082474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:35082534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769174.1

143 aa

143

CGI-121

PF08617 CGI-121 3-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769174.1`	Pfam	`PF08617`	CGI-121	Domain	3	141	1.7e-37	129.6	Kinase binding protein CGI-121

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913191.1
AAATCTCTTATGAAGAAGGAGATGAAACCTGGTTTTTGTGTGCAGAGAGCTTTTGGAGTTGATGCAAGCAGGGACTTTGGAACCAGAAGTAGCATTTCTCAATGCTTCACTTATACCAGATGTTTTCCCTGTTCTTGCTGCTGCATACAAGACGCTCGTAGCGAAATCACGAGACTCACTGATGACTCGCACTCTTCATTCGGAGCTTGTCTACAACTACTCGGGCTCCAAACATATATCGGAGTCCTTGAAGAGGTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989240
ATGCAAGCAGGGACTTTGGAACCAGAAGTAGCATTTCTCAATGCTTCACTTATACCAGATGTTTTCCCTGTTCTTGCTGCTGCATACAAGACGCTCGTAGCGAAATCACGAGACTCACTGATGACTCGCACTCTTCATTCGGAGCTTGTCTACAACTACTCGGGCTCCAAACATATATCGGAGTCCTTGAAGAGGTGCGGCATATCAGACAGCACCTCTTACATCCTCGCTGCTCGTTTTGGTGCTTCAGCTGATGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769174.1
MQAGTLEPEVAFLNASLIPDVFPVLAAAYKTLVAKSRDSLMTRTLHSELVYNYSGSKHISESLKRCGISDSTSYILAARFGASADEMTALKRLIKGTYIGLEELETRADQARIHKHYKISAPELGISSVADAITCRISARDAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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