当前解析结果
SmilChr06G002440| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002440 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002440 |
| 描述 | serine/threonine-protein kinase STY46-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 35145452 - 35152246 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989246 |
|---|---|
| GeneID | 130989246 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989246 |
| 原始查询 | LOC130989246 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | serine/threonine-protein kinase STY46-like |
| 产物 | serine/threonine-protein kinase STY46-like |
| Arabidopsis | AT4G38470 (STY46)ACT-like protein tyrosine kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830003] identity=72; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os09g0544300 (OsACTPK3)- identity=71.7; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF17667 (Pkinase_fungal) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989246 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057769183.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057769183.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057769183.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769183.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769183.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:35146123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A20,B103,B51 |
Chr6:35148645 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B12,C86 |
Chr6:35148670 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B131,C59 |
Chr6:35149378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:35151140 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr6:35151550 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B14,B27,B57,B59 |
Chr6:35152016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057769183.1PF07714
PK_Tyr_Ser-Thr 282-529 aa
PF00069
Pkinase 284-529 aa
PF17667
Pkinase_fungal 378-463 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057769183.1 |
Pfam | PF07714 |
PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 282 | 529 | 4.8e-76 | 256.2 | Protein tyrosine and serine/threonine kinase |
XP_057769183.1 |
Pfam | PF00069 |
Pkinase | Domain | 284 | 529 | 3.4e-61 | 207.7 | Protein kinase domain |
XP_057769183.1 |
Pfam | PF17667 |
Pkinase_fungal | Domain | 378 | 463 | 3.7e-06 | 26.6 | Fungal protein kinase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。