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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002486`

染色体: Chr06 坐标: 35731341-35736123 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002486`
名称	SmilChr06G002486
描述	translation initiation factor IF3-1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35731341 - 35736123 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989282`
GeneID	`130989282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989282`
原始查询	`LOC130989282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translation initiation factor IF3-1, mitochondrial
产物	translation initiation factor IF3-1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G34360` (AT1G34360) translation initiation factor 3 (IF-3) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840338] identity=38.9; qcov=0.517; evalue=1.87e-38; confidence=medium
Rice	`Os02g0101100` - identity=42.5; qcov=0.446; evalue=1.59e-46; confidence=low
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0006413 (translational initiation); GO:0032790 (ribosome disassembly); GO:0043022 (ribosome binding)
KEGG	-
Pfam	PF05198 (IF3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057769219.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057769219.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769219.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769219.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35731626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:35731787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:35735171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:35735230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:35735252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:35735472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35735643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35735722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C19
`Chr6:35735780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B90,B92
`Chr6:35735855`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35735855`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B107,B66,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769219.1

507 aa

254

507

IF3_N

PF05198 IF3_N 88-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769219.1`	Pfam	`PF05198`	IF3_N	Domain	88	155	2e-23	83.0	Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913236.1
ACTTCTTCCCCAATTCTCCAATCGAAATCTCGATTTAGGGTTTATCTCACTATTTTGTTCATCCACACTTGTTAGCAGCAGAGCTCGCTGATGCAAAATATGGTGCTTTGGAGTAGATTGAGGCAATCAAGGTTTAAAGTTCAAGCATTTTCCAACGATTTCAGGAGATTTTACAATTCAAATCCAGCTCCAGTTTTTGCAAATCAGCTCATTTCTTCTCGCAAATTAGCTCCGATTTTTAATTACCCTAAGTTTATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989282
ATGCAAAATATGGTGCTTTGGAGTAGATTGAGGCAATCAAGGTTTAAAGTTCAAGCATTTTCCAACGATTTCAGGAGATTTTACAATTCAAATCCAGCTCCAGTTTTTGCAAATCAGCTCATTTCTTCTCGCAAATTAGCTCCGATTTTTAATTACCCTAAGTTTATCGTTCAAGATGAGCAATTGGCGCTGTTCCGGAAAGTCAGATTCTACGCAAAACCTTTTAAGAAAAAAGGGGAGAAGGATGAAGGTGAGCCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769219.1
MQNMVLWSRLRQSRFKVQAFSNDFRRFYNSNPAPVFANQLISSRKLAPIFNYPKFIVQDEQLALFRKVRFYAKPFKKKGEKDEGEPMMNEEITAPMVRLVIDEDNHIIVSRYEALARAESLNLDLVEVDKNGKPPVCKIFDYNKQKYIRQTKEKERAKSKFTLKPGPAKEIKFGVKIKQNDLKIKADMVKRLMEKGYRVKCTAADAAEGVDLKSLLSQFTPLIDDVGVVESGPKYEKKQAFVVVRHVKFGPVNKKSSGKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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