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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002491`

染色体: Chr06 坐标: 35785569-35787160 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002491`
名称	SmilChr06G002491
描述	probable aquaporin PIP2-8
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35785569 - 35787160 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989288`
GeneID	`130989288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989288`
原始查询	`LOC130989288`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aquaporin PIP2-8
产物	probable aquaporin PIP2-8
Arabidopsis	`AT4G35100` (PIP3) plasma membrane intrinsic protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829662] identity=84; qcov=1; evalue=5.46e-174; confidence=high
Rice	`Os04g0233400` (OsPIP2) - identity=81.6; qcov=1; evalue=1.64e-169; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769229.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769229.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769229.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769229.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35785828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B32
`Chr6:35786007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:35786738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr6:35786753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B101,B140,B26,C40
`Chr6:35786892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B66,B98
`Chr6:35786940`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr6:35786940`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr6:35786947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769229.1

282 aa

141

282

MIP

PF00230 MIP 30-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769229.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	30	261	1.8e-84	283.7	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913246.1
AGAAAAAGAAAACAAAATATTAGGTAGCTTAATGGTATTACAAAAATACCCTTACCTTATCCGTTAATCATCAAGTGTCTCTCCCAACCTTAAATGCCATCGCCACCGCACTCAGCTCAGCTGCAGAAACCCAAAAAGAAAACTAGAGAGAGAAAGTAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGCTAAGATGACGAAAGAAGTGAGCGAAGAACCCGCCGCCCACGGCAGCAAGGACTACGTGGACCCGCCCCCGGCGGCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989288
ATGACGAAAGAAGTGAGCGAAGAACCCGCCGCCCACGGCAGCAAGGACTACGTGGACCCGCCCCCGGCGGCGTTCATCGGTGCAGGCGAGCTGAAGCTCTGGTCCTTCTACAGAGCCCTCATCGCCGAGTTCATTGCCACCCTCCTCTTCCTCTACGTCACCGTCGCCACCGTCATTGGCCACAAGAAGCTCAACGCCGCCGACCAATGCGACGGCGTCGGCCTCCTTGGCATCGCCTGGGCCTTCGGTGGCATGATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769229.1
MTKEVSEEPAAHGSKDYVDPPPAAFIGAGELKLWSFYRALIAEFIATLLFLYVTVATVIGHKKLNAADQCDGVGLLGIAWAFGGMIFILVYCTAGISGGHINPAVTFGLFLARKVSLIRAVSYIVSQCLGAICGVGLVKAFMKGPYNRLGGGANTVAPGYNTGTALGAEIIGTFVLVYTVFSATDPKRNARDSHIPVLAPLPIGFAVFMVHLATIPITGTGINPARSFGAAVIYGHQKSWDDHWIFWVGPMVGALAAAIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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