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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002493`

染色体: Chr06 坐标: 35817297-35821493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002493`
名称	SmilChr06G002493
描述	probable 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35817297 - 35821493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989290`
GeneID	`130989290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989290`
原始查询	`LOC130989290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3
产物	probable 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3
Arabidopsis	`AT1G20200` (EMB2719) PAM domain (PCI/PINT associated module) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838609] identity=81.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0550100` (OsRpn3) - identity=81.9; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000502 (proteasome complex); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0030234 (enzyme regulator activity); GO:0042176 (regulation of protein catabolic process)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01399 (PCI); PF08375 (Rpn3_C); PF25573 (TPR_PSMD3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769231.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769231.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769231.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769231.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769231.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35818795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr6:35820118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr6:35820241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C45,C52
`Chr6:35820804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:35820840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769231.1

488 aa

244

488

TPR_PSMD3_N

PCI

Rpn3_C

PF25573 TPR_PSMD3_N 24-317 aa PF01399 PCI 337-417 aa PF08375 Rpn3_C 421-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769231.1`	Pfam	`PF25573`	TPR_PSMD3_N	Repeat	24	317	6.1e-106	355.1	PSMD3-like, N-terminal TPR repeats
`XP_057769231.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	337	417	1.6e-18	67.4	PCI domain
`XP_057769231.1`	Pfam	`PF08375`	Rpn3_C	Family	421	486	2e-26	92.9	Proteasome regulatory subunit C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913248.1
AAATAAACCCTTCAATAGATGGAGTGTTGAAAAAGAAACATTTTACTCTACTTAGTTGGAGTTAAAAACTAATAACCTCCTATTTTACCAAACAAGCCCTTCAATTCTAGGGTTTTTCTTCATAATTCTGGCTCAATTCATCGAATCTGAGAAGTCTAGTTTTCGCGGTGGATCCAATTTGATCTGAAGAATAACTGTTTCACTCGATTTTAGATTTCGACGAAAATGACGCAAGACGTTGAGATGAAGGAGCAGCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989290
ATGACGCAAGACGTTGAGATGAAGGAGCAGCTGCCCACCCCATCGAATTCCGTCTCATCAACTTCTCCTTCAGCTCTTCAGCAACTGAAGGACATAGCTGCATTGATCGAGGTGGGGGCTTACGCTAGGGAAGTCCGTAGGATTGTCAGAGCTATTCGGTGGACAATCCAGCTGAGGAAGAAGCTCACTGCTTCCGTGGTTTCTGCATTTCTTAGTTTTGTGCTTTTGCCAGGATCCGAAGTGCATACTCGCTTGTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769231.1
MTQDVEMKEQLPTPSNSVSSTSPSALQQLKDIAALIEVGAYAREVRRIVRAIRWTIQLRKKLTASVVSAFLSFVLLPGSEVHTRLSSFVAKEDDHDMVIDTATSGTQTPAKHSLPELEIYSYLLVLIFLIDQKRYSEAKACSSAGIARLKSLNRRTVDVLASRLYFYYSISYELTGDLAEIRGNLLALHRTATLRHDELGQETLLNLLLRNYLHYNLYDQAEKLRSKAPRFEAHSNQQFSRYLFYLGKIRTIQLEYTDAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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