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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002509`

染色体: Chr06 坐标: 35986758-35989568 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002509`
名称	SmilChr06G002509
描述	WD-40 repeat-containing protein MSI2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35986758 - 35989568 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989306`
GeneID	`130989306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989306`
原始查询	`LOC130989306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD-40 repeat-containing protein MSI2-like
产物	WD-40 repeat-containing protein MSI2-like
Arabidopsis	`AT2G16780` (MSI2) Transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816179] identity=69.7; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0640100` (OsWD40-79) - identity=57.5; qcov=1.01; evalue=2.57e-159; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0010468 (regulation of gene expression); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF12265 (CAF1C_H4-bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769248.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769248.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769248.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769248.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35986972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:35987035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B91
`Chr6:35987068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B47,C81,C86,D11
`Chr6:35987153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:35988548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:35988550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:35989013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36
`Chr6:35989047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B74,C36,C46,C83
`Chr6:35989241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769248.1

392 aa

196

392

CAF1C_H4-bd

WD40

PF12265 CAF1C_H4-bd 9-78 aa PF00400 WD40 154-187 aa PF00400 WD40 201-236 aa PF00400 WD40 243-279 aa PF00400 WD40 285-323 aa PF00400 WD40 343-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF12265`	CAF1C_H4-bd	Repeat	9	78	1.7e-24	86.6	Histone-binding protein RBBP4 or subunit C of CAF1 complex
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	154	187	2.1e-29	101.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	201	236	2.1e-29	101.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	243	279	2.1e-29	101.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	285	323	2.1e-29	101.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057769248.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	343	379	2.1e-29	101.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913265.1
AACATCTCCATCCCCGCGAAATGCACTCAACACAATTGGCGGGAAAAGAAACCCTACTAAATCAGTAATCAAATGCTTCTTCACTCAGTTGTGCGTGAAAACATACCGTAACTGTGTGTGTATAGAGAGCAGTGAGAATGGAAGAGGTGGTGATGGTGGAGGAGGAGTTTTCGGTGTGGAAGAAGAACACGCCCTTGCTGTACGACCTCGTCATCTGCCACTCCCTTGAATGGCCGTCGCTTACCGTCCAGTGGCTTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989306
ATGGAAGAGGTGGTGATGGTGGAGGAGGAGTTTTCGGTGTGGAAGAAGAACACGCCCTTGCTGTACGACCTCGTCATCTGCCACTCCCTTGAATGGCCGTCGCTTACCGTCCAGTGGCTTCCGGTACCGCCTTCATCCGACGGCGGCGATCTCGCCGCGCACAAATTGATAATCGGGACGCATACATCCGATGATTACCCCAATTTTCTCATGCTCGCCGACGCGTACCTCCCACGGGACCCCACCTCCGCCATCGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769248.1
MEEVVMVEEEFSVWKKNTPLLYDLVICHSLEWPSLTVQWLPVPPSSDGGDLAAHKLIIGTHTSDDYPNFLMLADAYLPRDPTSAIEVDAENSIVPRVDIVQKIRVDGEVNRSRCMLQNPALIAAKTNIPEVFVFDTAKQLEDANVDSCNPDLRLRGHDKEGYGLSWSSFKEGYLLSGSNDCKICLWDVSAMPQEKVLDAKFTYEGHENVVEDVSWHLKNENLFGSVGDDCKLVIWDLRTNKFQQSVVVHEKEVNYLSFNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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