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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002510`

染色体: Chr06 坐标: 35991334-35994221 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002510`
名称	SmilChr06G002510
描述	basic leucine zipper 19-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35991334 - 35994221 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989308`
GeneID	`130989308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989308`
原始查询	`LOC130989308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	basic leucine zipper 19-like
产物	basic leucine zipper 19-like
Arabidopsis	`AT4G35040` (bZIP19) Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829656] identity=50.2; qcov=1.02; evalue=9.79e-85; confidence=high
Rice	`Os06g0716800` (OsbZIP53) - identity=48.3; qcov=0.944; evalue=8.7e-73; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769249.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769249.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769249.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769249.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35992730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:35992737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:35992826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B74,C36,C46,C83
`Chr6:35992916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B19,C57
`Chr6:35993089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:35993281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C81,C86
`Chr6:35993416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:35993498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B12,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769249.1

288 aa

144

288

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 105-159 aa PF00170 bZIP_1 107-153 aa

XP_057769250.1

287 aa

144

287

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 105-159 aa PF00170 bZIP_1 107-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769249.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	105	159	4.1e-12	46.7	Basic region leucine zipper
`XP_057769249.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	107	153	3.4e-07	31.0	bZIP transcription factor
`XP_057769250.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	105	159	4.1e-12	46.7	Basic region leucine zipper
`XP_057769250.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	107	153	3.4e-07	31.0	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913267.1
AGCCTAGTGATTCGCAATCAACGAAAGTAAAAAGTTGTTAGCTATAAATAAAGAAATGCAGTGAAAAATTGGTTCAGCTGTCTGGAATTTGAGGAATCTTGAATCAATGGCTCCTGTAAATCGCCCCGTTTCTTTCCCCCATTGAATTGTCGCCATTTGTATCCTTCGCTAAAGCTCTTTTTAGCCCTTTTCCTAGGGCTTCCTTTCCCCCCTTATAAATCCCCTCGTCACCCCAATTTCCGCGTCGTGCTGCTTGCTCT...

XM_057913266.1
CAACGAAAGTAAAAAGTTGTTAGCTATAAATAAAGAAATGCAGTGAAAAATTGGTTCAGCTGTCTGGAATTTGAGGAATCTTGAATCAATGGCTCCTGTAAATCGCCCCGTTTCTTTCCCCCATTGAATTGTCGCCATTTGTATCCTTCGCTAAAGCTCTTTTTAGCCCTTTTCCTAGGGCTTCCTTTCCCCCCTTATAAATCCCCTCGTCACCCCAATTTCCGCGTCGTGCTGCTTGCTCTTGCGCTAAAGATTCAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989308
ATGGATGATGGGGAGCTTGATTTCCCAAATGACCAAATGTTGTCATGCTTGGACATAACTAATGCTCAGAGCAGTTGCTCGTTCGACATAGACGAGTTTCTTAGTCGGACGCAGTCTTGCAATGATGCCCTTGGTCGAACAGAGGCTTACACCGATGGTCTTGGTCGAACACAGGCCTGCACTCATGCTCATGCTTGCAACCCGTCGGGCCCTGATCAATCCCACACGCATACGTGCATTCATGTCCACACGCAAATTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769249.1
MDDGELDFPNDQMLSCLDITNAQSSCSFDIDEFLSRTQSCNDALGRTEAYTDGLGRTQACTHAHACNPSGPDQSHTHTCIHVHTQIMPSPSEGQDPSDDTAESVDKKSKKRPLGNREAVRKYREKKKARAASLEDEVIRLRALNQQLMKRLQGQALLEAEVARLKCLLVDIRGRIEGEIGSFPYQKPNKSEDVYQNMANPNNPGRYVINPCNMQRNDPLYCIHPGSEAALSGQGLGDCGFDNLQCPGNQNSDPEEFPDCG...

XP_057769250.1
MDDGELDFPNDQMLSCLDITNAQSSCSFDIDEFLSRTQSCNDALGRTEAYTDGLGRTQACTHAHACNPSGPDQSHTHTCIHVHTQIMPSPSEGQDPSDDTAESVDKKSKKRPLGNREAVRKYREKKKARAASLEDEVIRLRALNQQLMKRLQGQALLEAEVARLKCLLVDIRGRIEGEIGSFPYQKPNKSEDVYQNMANPNNPGRYVINPCNMQRNDPLYCIHPGSEAALSGQGLGDCGFDNLQCPGNQNSDPEEFPDCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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