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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002511`

染色体: Chr06 坐标: 35998837-36002987 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002511`
名称	SmilChr06G002511
描述	protein kinase STUNTED-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	35998837 - 36002987 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989309`
GeneID	`130989309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989309`
原始查询	`LOC130989309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein kinase STUNTED-like
产物	protein kinase STUNTED-like
Arabidopsis	`AT1G77280` (AT1G77280) kinase with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844064] identity=40.8; qcov=1.05; evalue=2.45e-164; confidence=medium
Rice	`Os03g0241600` (OsRLCK105) - identity=42.9; qcov=1.02; evalue=4.84e-172; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00582 (Usp); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769251.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057769251.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769251.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769251.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:35999470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:35999784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:36000741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C51
`Chr6:36000741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:36000807`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A22,C81,C86
`Chr6:36000807`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A22,C81,C86
`Chr6:36001066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C52
`Chr6:36001169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:36001676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B34,C59,C85,D10
`Chr6:36001718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B34,C59,C85,D10
`Chr6:36002286`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B64
`Chr6:36002286`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769251.1

728 aa

364

728

Usp

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00582 Usp 10-129 aa PF00069 Pkinase 377-647 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 379-649 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769251.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	10	129	7.1e-07	30.6	Universal stress protein family
`XP_057769251.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	377	647	8.7e-40	137.5	Protein kinase domain
`XP_057769251.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	379	649	1.8e-38	133.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913268.1
GATTCTTCCATGCAGCCTTTGTTTCTCTCTCATCATTTCCGTACATTCTCAATCCTAGTAAAAAAGGAATTAATCGGATAAAGCCAATCCCTTGCAGTAAAATTGATTGTTTACGGCTCCATTTCAGCAGCCCCTTTTGAAATTTAAAATATTGTTTGGTAGCTGAGAGTAGGTCAGCTCAGGATCATCGGTGGCGGTATTTTCTTGATTTTAAATGTTGGATGGCTTTGAATGGAAGGGAATATTCAAAAAATTTAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989309
ATGAAAGTTGAGAGGTTGGATTTGGGGAGGAAGAAAGTGATTGTGGGGATAAGGTTGGATGGTTATGCTAAAGAGTTGCTGGATTGGGCTGTGGTTAAAGTAGCCGATCCAGGCGACTCCGTTGTGGCGATTCATGTTTGCAGGAATTCAGGTTACATTCCGAAGGAGAAAGTGTTGTTGGATGGTTACTTGGAAGACTATGAAGGTCTATGCAACAAAAAGCAGGTTTCTCTCAGTGCTGAAGTCATGAAAGGGAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769251.1
MKVERLDLGRKKVIVGIRLDGYAKELLDWAVVKVADPGDSVVAIHVCRNSGYIPKEKVLLDGYLEDYEGLCNKKQVSLSAEVMKGNSIRKALVREAKTHGASTVIVGITRNSALGGRASIAKYCAKKLPLTIEVMAIHNGKVAFSRCSKISLEGVSLDPKASAYGNDSLSTRDTYSEFGESEISEMSRFSFDARDGNMSSRDDAMSPIGRLKRVSLSSIFSLPAEQRPGWPLLETVSSRDDSVSPIGRLQRGSLSSISLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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