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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002516`

染色体: Chr06 坐标: 36058423-36063499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002516`
名称	SmilChr06G002516
描述	synaptotagmin-1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36058423 - 36063499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989313`
GeneID	`130989313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989313`
原始查询	`LOC130989313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	synaptotagmin-1-like
产物	synaptotagmin-1-like
Arabidopsis	`AT2G20990` (SYTA) synaptotagmin A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816633] identity=74.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0448400` (OsNTMC2T1.1) - identity=73.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF17047 (SMP_LBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769257.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057769257.1`
3	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057769257.1`
4	Membrane raft	膜筏	0.20000	`XP_057769257.1`
5	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057769257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36059903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C19
`Chr6:36060226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B59,B78
`Chr6:36060487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:36060488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:36061677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A6,B125,C87
`Chr6:36061771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:36061925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:36062138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769257.1

538 aa

269

538

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 67-246 aa PF00168 C2 260-357 aa PF00168 C2 418-521 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769257.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	67	246	4.1e-16	59.7	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057769257.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	260	357	3.3e-42	143.7	C2 domain
`XP_057769257.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	418	521	3.3e-42	143.7	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913274.1
ATTCCGCGGAAGGCTCAACGTGGCCGCACGCTACAGAGCGAAATGACCATAATGGGTACGAAACGGCACGACTTTTACCGTTTTACCGCTCTACTCGGAGTCTGCCGCGGGGGCTCTTTCGGTCATTTCGTAATTTTATTCATTTTATTACACCATATATTATCCATCGAAATTACTGGAAATTAAACAGCTATTAGAGAGAGAGAGAAATGATTCTGGGAAGGACTTGTAGAAGAAACTTGGTCGAATTATTGGACTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989313
ATGGGTTTTGTCAGTATGATAATGGGGTTTTGTGGATTTGGAGTAGGGATTTCTTCTGGATTGTTTGCTGGATATTTCTTGTTCATCTACTTTCAGCCTTGCGATGTTAAGAATCCTACCATCCGCCCTTTGGTTGAGCAAGACTCTAAGACTTTGCAACAATTACTACCTGAAATACCCTTTTGGGTGAAAAATCCAGACTATGATCGTCTTGACTGGCTTAACAAGTTTCTTGAAGTTATGTGGCCTTACCTGGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769257.1
MGFVSMIMGFCGFGVGISSGLFAGYFLFIYFQPCDVKNPTIRPLVEQDSKTLQQLLPEIPFWVKNPDYDRLDWLNKFLEVMWPYLDKAICKTAKNIATPIISEQIPKYKIESLEFEALTLGSLPPTFQGMKVYLTEEKELIMEPALKWAGNPNVTVAVKAYGLKTTVQVVDLQVFALPRITLKPLVPSFPCFANIIVSLMEKPHVDFGLKLGGADLMSIPGLYRFVQETIKDQVANMYLWPKTLEVQVLDPTKAMKKPVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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