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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002520`

染色体: Chr06 坐标: 36148314-36151013 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002520`
名称	SmilChr06G002520
描述	protein EARLY-RESPONSIVE TO DEHYDRATION 7, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36148314 - 36151013 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989317`
GeneID	`130989317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989317`
原始查询	`LOC130989317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EARLY-RESPONSIVE TO DEHYDRATION 7, chloroplastic-like
产物	protein EARLY-RESPONSIVE TO DEHYDRATION 7%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G17840` (ERD7) Senescence/dehydration-associated protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816293] identity=56.5; qcov=1.03; evalue=3.53e-149; confidence=high
Rice	`Os03g0241900` - identity=45.5; qcov=1.07; evalue=5.9e-112; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06911 (Senescence)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057769261.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057769261.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057769261.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769261.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36148559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36148622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:36148690`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C30
`Chr6:36148690`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C30
`Chr6:36148822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B64,B66,B98,C36
`Chr6:36148875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:36149137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:36149143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B66,B98
`Chr6:36149187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:36149830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B38,B39,B51,C55
`Chr6:36150057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr6:36150070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769261.1

443 aa

222

443

Senescence

PF06911 Senescence 244-431 aa

XP_057769262.1

381 aa

190

381

Senescence

PF06911 Senescence 244-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769261.1`	Pfam	`PF06911`	Senescence	Family	244	431	3e-48	164.9	Senescence domain
`XP_057769262.1`	Pfam	`PF06911`	Senescence	Family	244	381	3.5e-33	115.8	Senescence domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913278.1
ATTCTTTATTTTTCTATTACCGAATGACCTAAACGGTACAAATTGTTTTAAATTAAATATCTACCGACGTGTGGATAAATATATATATGTATATTTAAAAAAAATCTCAAAAACAAACAAATTAGTAAACCGTTAACAGTTACCTTTTACAGCTTACCGCCGCGGCAGCAACGCGGCTTCTGCGTCTCTTGCTTCGTGTCACAGTCTTCACACTTTCTCCCTCTCCTTCAACCGACATCGCCATTTCTTTCCTTAATTGC...

XM_057913279.1
ATTCTTTATTTTTCTATTACCGAATGACCTAAACGGTACAAATTGTTTTAAATTAAATATCTACCGACGTGTGGATAAATATATATATGTATATTTAAAAAAAATCTCAAAAACAAACAAATTAGTAAACCGTTAACAGTTACCTTTTACAGCTTACCGCCGCGGCAGCAACGCGGCTTCTGCGTCTCTTGCTTCGTGTCACAGTCTTCACACTTTCTCCCTCTCCTTCAACCGACATCGCCATTTCTTTCCTTAATTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989317
ATGTCTTCAAACACTCCTAAATCTCTCTATCCAGAAGTTCCCCTAACCAACCCAGAATCCAACTCTCCATTCATCCCCAATAACTCTTCTTCATCCTCTTCCATGTATCCGACAATCCAGATGAATGAATTAGCTGAGAATCTGTTTCCTGAGACCGACGAAGAAGAAATCCCCAAAAGAGGGGCGCCGAATCAACCCGAATTCGAGTCGTTCGAGCAAGTTCTCGTCACGATTCCGGGCGCGATCGTGCACTTGATCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769261.1
MSSNTPKSLYPEVPLTNPESNSPFIPNNSSSSSSMYPTIQMNELAENLFPETDEEEIPKRGAPNQPEFESFEQVLVTIPGAIVHLIDKHRSVELASGDFEVVQLLQGGNAVAALARIGEEIQWPLARDEAAVKLDDSHYFFSLRVPASADGGNGDDLLNYGLTIAAKGQEGKVRELDAVLEKFSAFKVEEAAAGVEQGWWGAVTRGVSPEEMKGEKKEEVEKSATAYWTTLAPNVEEYSGSVAKMIAAGSGQLVRGILWC...

XP_057769262.1
MSSNTPKSLYPEVPLTNPESNSPFIPNNSSSSSSMYPTIQMNELAENLFPETDEEEIPKRGAPNQPEFESFEQVLVTIPGAIVHLIDKHRSVELASGDFEVVQLLQGGNAVAALARIGEEIQWPLARDEAAVKLDDSHYFFSLRVPASADGGNGDDLLNYGLTIAAKGQEGKVRELDAVLEKFSAFKVEEAAAGVEQGWWGAVTRGVSPEEMKGEKKEEVEKSATAYWTTLAPNVEEYSGSVAKMIAAGSGQLVRGILWC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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