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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002532`

染色体: Chr06 坐标: 36337704-36341471 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002532`
名称	SmilChr06G002532
描述	auxin transporter-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36337704 - 36341471 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989329`
GeneID	`130989329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989329`
原始查询	`LOC130989329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin transporter-like protein 2
产物	auxin transporter-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G21050` (LAX2) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816640] identity=86.6; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0244600` (OsLAX2) - identity=86.8; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769274.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769274.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769274.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769274.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36337931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B83,C59
`Chr6:36338025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:36338401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B84,C82
`Chr6:36338418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A3,B77
`Chr6:36338449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:36338904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:36339048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B58,C5,C80
`Chr6:36340760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:36340772`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B136
`Chr6:36340772`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B136
`Chr6:36340858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B90,B92
`Chr6:36340904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B65,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769274.1

492 aa

246

492

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 39-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769274.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	39	432	1.8e-77	261.5	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913291.1
CCCTACCCCAACCCCCCACCCAACCCCACCAACAATATATATGTATATATATAGATACACAATCTTCTTCATACATGCTGCATTGCAAACTTGCATTACATCGTGCTAGCTTAGCTAATTAACACAGTTCCAAAACAAAGCCAAATTTCTTTATAAGAAAAAAATGGAGTCTTCGGACAAGGCGGCGGAGAGTGTGGTGGTCGGAAGCTACGTGGAAATGGAGGCGGCGGAAGGGAAGCCTTCCGGCATGAAATCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989329
ATGGAGTCTTCGGACAAGGCGGCGGAGAGTGTGGTGGTCGGAAGCTACGTGGAAATGGAGGCGGCGGAAGGGAAGCCTTCCGGCATGAAATCAAGAATCTCGAAGCTCTTCTGGCACGGCGGCTCCGCCTACGACGCCTGGTTCAGCTGCGCCTCCAACCAGGTGGCGCAAGTGCTGCTGACGTTGCCCTACTCGTTCTCGCAGCTGGGGATGACGTCAGGAATTCTCTTCCAATTATTTTATGGGTTGCTTGGGAGTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769274.1
MESSDKAAESVVVGSYVEMEAAEGKPSGMKSRISKLFWHGGSAYDAWFSCASNQVAQVLLTLPYSFSQLGMTSGILFQLFYGLLGSWTAYLISILYVEYRTRKEREKVVFRNHVIQWFEVLDGLLGKHWRNVGLAFNCTFLLFGSVIQLIACASNIYYINDNLDKRTWTYIFGACCATTVFIPSFHNYRIWSFLGLIMTTYTAWYLTIASLLHGQVEGVTHSGPTKMVLYFTGATNILYTFGGHAVTVEIMHAMWKPQKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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