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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002560`

染色体: Chr06 坐标: 36768845-36773908 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002560`
名称	SmilChr06G002560
描述	cytochrome c oxidase subunit 5C-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	36768845 - 36773908 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989356`
GeneID	`130989356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989356`
原始查询	`LOC130989356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase subunit 5C-like
产物	cytochrome c oxidase subunit 5C-like
Arabidopsis	`AT5G40382` (AT5G40382) Cytochrome c oxidase subunit Vc family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241321] identity=70.7; qcov=0.967; evalue=4.16e-25; confidence=medium
Rice	`Os12g0561000` (COX5C) - identity=66.7; qcov=0.95; evalue=7.99e-25; confidence=medium
GO	GO:0005746 (GO:0005746)
KEGG	-
Pfam	PF30944 (COX5C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057769294.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057769294.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057769294.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769294.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769294.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:36770584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:36770596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:36770624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B98
`Chr6:36770644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B35
`Chr6:36770680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B18,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769294.1

60 aa

COX5C

PF30944 COX5C 19-43 aa

XP_057769295.1

60 aa

COX5C

PF30944 COX5C 19-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769294.1`	Pfam	`PF30944`	COX5C	Family	19	43	3.4e-13	49.5	Cytochrome c oxidase subunit 5C
`XP_057769295.1`	Pfam	`PF30944`	COX5C	Family	19	43	3.4e-13	49.5	Cytochrome c oxidase subunit 5C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913311.1
GTAATATGAAAAAAAAAAAAAAAAACACACGCGTCCGCATACAATCGTTCCACGTTTCGATTCGAGATACTTCGTATTAACCATTTCTTCTGAGTTTTTCCTCTCGACATTTTGGGATCTCGTAGTCGTCGCCTCAACAATTTTGCATCGAAACGTTTTGGTTTCATAGAAGACAATGGCTGGTCATATAGTTTACAAGGGCCCGAGTGTCATAAAGGAGATCATTATCGGGATCGGCCTCGGCATGGTGGCCGGAGGAT...

XM_057913312.1
TGTTTCTTTTTGTATAATTTTGAGCTTGCTTCAGCGTTCATCAATTTCATTTTATTCGTCGTGAATTTGGTTTTGGTTCGGCGATTTTTTTTCAATTATTATTCTTGTTTTTCTGTGTGTTATGCTCAAAATAGTTTTGGTTTCATAGAAGACAATGGCTGGTCATATAGTTTACAAGGGCCCGAGTGTCATAAAGGAGATCATTATCGGGATCGGCCTCGGCATGGTGGCCGGAGGATTTTTTAAAATGTACCACTGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989356
ATGGCTGGTCATATAGTTTACAAGGGCCCGAGTGTCATAAAGGAGATCATTATCGGGATCGGCCTCGGCATGGTGGCCGGAGGATTTTTTAAAATGTACCACTGGGAAGAGCAACGGAAGACTAGGGAGTTCTATGATCTTCTCGAGAAGGGTGAGATCACCGTCGTTAGAGAAGATGAGTAG

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769294.1
MAGHIVYKGPSVIKEIIIGIGLGMVAGGFFKMYHWEEQRKTREFYDLLEKGEITVVREDE

XP_057769295.1
MAGHIVYKGPSVIKEIIIGIGLGMVAGGFFKMYHWEEQRKTREFYDLLEKGEITVVREDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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