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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002576

染色体: Chr06 坐标: 36993356-36999122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002576
名称SmilChr06G002576
描述bifunctional protein FolD 2-like
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向36993356 - 36999122 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130989368
GeneID130989368
locus_tag-
NCBI NameLOC130989368
原始查询LOC130989368

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述bifunctional protein FolD 2-like
产物bifunctional protein FolD 2-like
ArabidopsisAT3G12290 (AT3G12290)
Amino acid dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820409]
identity=75.8; qcov=0.99; evalue=1.1e-157; confidence=high
RiceOs05g0150800
-
identity=73.6; qcov=0.97; evalue=1.59e-152; confidence=high
GOGO:0004477 (methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity); GO:0004488 (methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0035999 (tetrahydrofolate interconversion)
KEGG-
PfamPF00763 (THF_DHG_CYH); PF02882 (THF_DHG_CYH_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130989368

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057769312.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057769312.1
3 Mitochondrion 线粒体 0.20000 XP_057769312.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057769312.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057769312.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769312.1
297 aa
N
1
148
297
THF_DHG_CYH
THF_DHG_CYH_C
C
PF00763 THF_DHG_CYH 9-124 aa PF02882 THF_DHG_CYH_C 146-293 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057769312.1 Pfam PF00763 THF_DHG_CYH Domain 9 124 4.7e-38 130.7 Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, catalytic domain
XP_057769312.1 Pfam PF02882 THF_DHG_CYH_C Domain 146 293 1.8e-53 180.7 Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, NAD(P)-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057913329.1
ATGTCGGATCACAAGGTTACTATAATCGACGGCAAAGCAGTCGCCCAAACAATCCGATCGAAGATCGCCGCCGAAGTCTGCCGCCTCTCTGAAACGTACATCAAGGTTCCTGGTCTAGCTGTTATGATTGTAGGGCAAAGGAAGGATTCACAGAGCTATGTGAATATGAAAAGGAAAGCTTGTGCAGAAGTTGGAATCAAGTCGATTGATTTGGACCTACTAGAGAATGTATCCGAATCTGAATTGATTAGCAAAGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130989368
ATGTCGGATCACAAGGTTACTATAATCGACGGCAAAGCAGTCGCCCAAACAATCCGATCGAAGATCGCCGCCGAAGTCTGCCGCCTCTCTGAAACGTACATCAAGGTTCCTGGTCTAGCTGTTATGATTGTAGGGCAAAGGAAGGATTCACAGAGCTATGTGAATATGAAAAGGAAAGCTTGTGCAGAAGTTGGAATCAAGTCGATTGATTTGGACCTACTAGAGAATGTATCCGAATCTGAATTGATTAGCAAAGTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057769312.1
MSDHKVTIIDGKAVAQTIRSKIAAEVCRLSETYIKVPGLAVMIVGQRKDSQSYVNMKRKACAEVGIKSIDLDLLENVSESELISKVHELNVNPDVHGILGQLPLPKHINEEKILTEISLGKDVDGFHPLNIGKLAMKGRDPCLFRPCCPETCYYILTRHGITIKGKNVVVVGRSNIVVLPVSLLLLKEDATVTMVHSRTKEPESIVRNADIIIAVVGQAAMIKGSWIKPGAVVIDVRTNAVDDPGKKSGYRLVGDVDFQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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