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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002628`

染色体: Chr06 坐标: 37851251-37855309 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002628`
名称	SmilChr06G002628
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37851251 - 37855309 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989380`
GeneID	`130989380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989380`
原始查询	`LOC130989380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2-like
产物	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2-like
Arabidopsis	`AT3G27960` (KLCR2) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822420] identity=58.1; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0708400` (49D11.11) - identity=56.1; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF13374 (TPR_10); PF13424 (TPR_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769326.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057769326.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769326.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769326.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37851718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:37852282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26
`Chr6:37852338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr6:37852618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B8,C25,C30,C81
`Chr6:37852851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B78,C60,D5
`Chr6:37852879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C24,D4
`Chr6:37853011`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B52,C34,C74,D3
`Chr6:37853011`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B52,C34,C74,D3
`Chr6:37853031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,C34,C74,D3
`Chr6:37853072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B71,D5
`Chr6:37853083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B71,D5
`Chr6:37853147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B52,C34,C74,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769326.1

743 aa

372

743

TPR_10

TPR_12

TPR_8

TPR_12

TPR_10

PF13374 TPR_10 283-311 aa PF13424 TPR_12 447-522 aa PF13181 TPR_8 492-522 aa PF13424 TPR_12 618-690 aa PF13374 TPR_10 658-699 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769326.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	283	311	1.5e-26	92.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769326.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	447	522	6.8e-43	145.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769326.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	492	522	2.3e-17	62.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769326.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	618	690	6.8e-43	145.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769326.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	658	699	1.5e-26	92.2	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913343.1
AAAAAAAGAAAAGAAAAAGACAAGTCACAATAAAATAAATAAAAAATATGATAGAAGAGACCAAAAATAAACCGAAAAATACAAAAACGCAATTTCGGCGGTTGCCAACGGCGGAGGGCGGTGGCGGTGGCGGAAGATGATAAGTCCTCTTCAGCGTTGGAACATTTCAACTTCTTTGCTCCCACCTATACATACACACACACACACACTATAATGTATAAATTTAAACTTGGAATTATCTACCTACATTTGTCAAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989380
ATGCCTGAGTTCAACGTGGAGGAATTAAACAGTGAGAGGTTCGCCAAGGAGCAGGAGGAGCAGCAGCATTATGTTCCTCGCAAGGAGATTTTTATGGAGAGGTCTCCTCGTAGCCCGCTGAGCACGCACAGCCCCCCAATGAGCTCAGCGAGCCGTGACAGCGACTCTCTCGACCTAGCCATTGATGGGGTGGTGGACAACACCATTGAGGACCTCTACAACAATGTGTGTGAGATGCAGAGCTCGGATCACTCTCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769326.1
MPEFNVEELNSERFAKEQEEQQHYVPRKEIFMERSPRSPLSTHSPPMSSASRDSDSLDLAIDGVVDNTIEDLYNNVCEMQSSDHSPSRRSYLSYGEESRIDSELHFLAGGEHGVVEMKKELVSGSNGGGGGEREGKKVVVMDDSFGERFRINPAGFSCGSPTAQSQVRRLSCLELPSEASKKATLRSKTQNGRPPNGKQPHAKGVKKLGTASSLKIERGKVQSVAEENGGEAKFLGPYLLKQARDMIATGVNPQKALDSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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