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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002616

染色体: Chr06 坐标: 37629840-37638274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002616
名称SmilChr06G002616
描述serine/threonine-protein kinase BLUS1-like
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向37629840 - 37638274 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130989386
GeneID130989386
locus_tag-
NCBI NameLOC130989386
原始查询LOC130989386

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述serine/threonine-protein kinase BLUS1-like
产物serine/threonine-protein kinase BLUS1-like
ArabidopsisAT5G14720 (AT5G14720)
Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831324]
identity=59.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
RiceOs06g0486400
-
identity=54.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GOGO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0043539 (protein serine/threonine kinase activator activity)
KEGG-
PfamPF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130989386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057769337.1
2 Cytosol 细胞质基质 1.00000 XP_057769337.1
3 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057769337.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057769337.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057769337.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:37630700 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C17
Chr6:37630898 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C74
Chr6:37634501 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C86
Chr6:37635809 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A16,C26
Chr6:37635812 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C51,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769337.1
690 aa
N
1
345
690
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 16-277 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-273 aa
XP_057769338.1
690 aa
N
1
345
690
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 16-277 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-273 aa
XP_057769339.1
690 aa
N
1
345
690
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
C
PF00069 Pkinase 16-277 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 17-273 aa
XP_057769340.1
625 aa
N
1
312
625
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 4-208 aa PF00069 Pkinase 5-212 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057769337.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 16 277 1.3e-58 199.2 Protein kinase domain
XP_057769337.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 17 273 5.9e-43 147.8 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057769338.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 16 277 1.3e-58 199.2 Protein kinase domain
XP_057769338.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 17 273 5.9e-43 147.8 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057769339.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 16 277 1.3e-58 199.2 Protein kinase domain
XP_057769339.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 17 273 5.9e-43 147.8 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057769340.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 4 208 1.8e-34 120.0 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057769340.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 5 212 1.2e-47 163.2 Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057913356.1
GAGCAACTAAACAATCCATTCAAAATGTTACGCTTGTCATACAGTAGAACTACGGATTCAACTTCTATCTAAATTTGCGATATACGCGAAAGATTTTATAGCTAGCTAGCTATTCAATCGACAATCTGAGATCGTCTATGGCGGTTGCTCAATAACGGAAGCTCTATCATCGCCGCCGCAGATGCCGTCTCCTTTCGCCTGCGTTTGGATTTTATCGTTGATCAGGCGGTGAATATCGTCGCATTTCTCATCCCGGCGAT...
XM_057913357.1
AGCAACTAAACAATCCATTCAAAATGTTACGCTTGTCATACAGTAGAACTACGGATTCAACTTCTATCTAAATTTGCGATATACGCGAAAGATTTTATAGCTAGCTAGCTATTCAATCGACAATCTGAGATCGTCTATGGCGGTTGCTCAATAACGGAAGCTCTATCATCGCCGCCGCAGATGCCGTCTCCTTTCGCCTGCGTTTGGATTTTATCGTTGATCAGGCGGTGAATATCGTCGCATTTCTCATCCCGGCGATT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
LOC130989386
ATGAAGCAGCCATCAGAGAAGAAATTCCCCCTTTCTGCTAAAGATTACAAGTTGTGTGAGGAAATTGGAGAAGGTGTCAGTGCTACTGTTTATAGAGCCATTTGTTTACCGCTTAATGAGAGTGTTGCAATCAAAGTTCTTGATCTTGAGAAGTGCAATAATGACTTGGATGGCATCCGACGAGAAGTACAGACAATGATTTTGACTGGCCACCCAAATGTATTGCAAGCTCACTGCTCCTTCACTGTGGGGCATAACCT...
LOC130989386
ATGAAGCAGCCATCAGAGAAGAAATTCCCCCTTTCTGCTAAAGATTACAAGTTGTGTGAGGAAATTGGAGAAGGTGTCAGTGCTACTGTTTATAGAGCCATTTGTTTACCGCTTAATGAGAGTGTTGCAATCAAAGTTCTTGATCTTGAGAAGTGCAATAATGACTTGGATGGCATCCGACGAGAAGTACAGACAATGATTTTGACTGGCCACCCAAATGTATTGCAAGCTCACTGCTCCTTCACTGTGGGGCATAACCT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057769337.1
MKQPSEKKFPLSAKDYKLCEEIGEGVSATVYRAICLPLNESVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMILTGHPNVLQAHCSFTVGHNLWVVMPYMGGGSCLHIMKSAYPEGFEEPVIATVLCEVLKALVYLHAHGHIHRDVKAGNILIDTNGSVRLADFGVSACMFDTGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYERDRRFSKSFKDLVAACLVK...
XP_057769338.1
MKQPSEKKFPLSAKDYKLCEEIGEGVSATVYRAICLPLNESVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMILTGHPNVLQAHCSFTVGHNLWVVMPYMGGGSCLHIMKSAYPEGFEEPVIATVLCEVLKALVYLHAHGHIHRDVKAGNILIDTNGSVRLADFGVSACMFDTGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYERDRRFSKSFKDLVAACLVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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