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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002601`

染色体: Chr06 坐标: 37376772-37380284 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002601`
名称	SmilChr06G002601
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37376772 - 37380284 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989405`
GeneID	`130989405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989405`
原始查询	`LOC130989405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=33.7; qcov=0.741; evalue=1.32e-56; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=35.5; qcov=0.894; evalue=1.03e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769371.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769371.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769371.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769371.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37378315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:37378389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:37378395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:37378418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B36
`Chr6:37378440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A18,A20,A9,B1,B10,B123,B127,B13,B19,B28,B36,B45,B72,B9,B99,C10,C3,C51,C54,C56,C65,D1
`Chr6:37378441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B101,B13,B23
`Chr6:37378441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,B23
`Chr6:37378451`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A24,A7,B100,B125,B34,B46,B57,B72,B91,B98,C32,C48,C5,C62,C68,C70,C8
`Chr6:37378455`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A24,A7,B100,B125,B34,B46,B57,B72,B91,B98,C32,C48,C5,C62,C68,C70,C8
`Chr6:37378459`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A10,A13,B139,B68,C35,C4
`Chr6:37378494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A19,A23,C42,D8
`Chr6:37378505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B21,B78,C37,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769371.1

444 aa

222

444

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 104-190 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 287-396 aa PF10551 MULE 313-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769371.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	104	190	6.6e-18	65.9	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057769371.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	287	396	3e-09	37.6	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057769371.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	313	407	1.7e-26	93.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913388.1
TACAGCTCGTCCGTTACGATTGAGACACGTGTAATGTCAAAAGAAATAAAAAAAAGAGGTAACCATGGTTTGGGTGGGCCGCCCGAGGGAAAAATTGCAGAAAATTTCCACCCGAAGAAGAAACCGATCGGTGCCCGCTGCTCGTTGAGAGGGCTTGGCCGAGAGCAACATTGTTCAACGCAAGATTTAAATCCGAATCCGAAAATGTCTTCAGATTCAGGAACGATGGCGTATACAAAAAGTGCCTGCAATTTTCGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989405
ATGGCCGAGGATCAAACGAAGTCTAGGGAAAGCATTGATTTGAATCGAGTACTGGGTTTCGAAGAGAGTGACGACGACGTCTCAAGCGGTCCAAAAAATGATCCAAAAGAGGCGTCTGATGCTGCTAAAGAAAAAGTAGAGTTTCACTCTGATGCACATGAATGTGACGAGAATGGTGAAGATGGTGTTTCTGGTGAGAAGGATGCACATGATGAAGTTTTTGATAAATTAACCGTTCCCGAATGGGAGGAAATGCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769371.1
MAEDQTKSRESIDLNRVLGFEESDDDVSSGPKNDPKEASDAAKEKVEFHSDAHECDENGEDGVSGEKDAHDEVFDKLTVPEWEEMLAVGSTLSTNLVHIFGYCLTYSHKKGFSVRRGDEKRFGQRGDIRLKQFLCSSSGLTDMKRQKTSSGVYKKMVTRTNCAAQLVVSRKDEGPFVVSIFETVHNHELIATDMSYMLRSNRNLNIGHQSVLQAMKDAGIGVSVACKFMKKESGGVPNVGFTRKDAYNHIDRVKRLSKLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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