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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002670`

染色体: Chr06 坐标: 38609805-38613482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002670`
名称	SmilChr06G002670
描述	CASP-like protein 4A1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38609805 - 38613482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989417`
GeneID	`130989417`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989417`
原始查询	`LOC130989417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 4A1
产物	CASP-like protein 4A1
Arabidopsis	`AT5G40300` (AT5G40300) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834028] identity=52; qcov=0.577; evalue=4.26e-63; confidence=medium
Rice	`Os01g0661000` - identity=49; qcov=0.443; evalue=5.75e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989417

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769400.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769400.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769400.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769400.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38612591`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr6:38612591`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr6:38612733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B21,B35
`Chr6:38613086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr6:38613127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769400.1

350 aa

175

350

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 195-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769400.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	195	332	1.3e-29	103.6	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913417.1
TAAAACAAACATCCAAATTCGAAAACCTGTGACAAATTGGTCCCTAAAAAAACAATATAGACACAAAAATAATAATAATAAAGTAAATAAAGAAAAACTCACTCTCACAATCTCACTCCTTCCAAAACTCCCAAACACAGAAACCAGCTCCAGAAATAAAAAGATTGAAAAATAGCAGCTGCGAAAACCAATTTCATTTTTTTTATTAAAATCAACCGACGCTAAAATCTCGGAAATTTGAAATTCCCTTTTTATGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989417
ATGGAAAATCAAAATAATCACCCGCCGCCACCTGAAACTGAAGCAGCTCCACCTCCGCCGCTAAAATCTGCAAACCACGCCCCCTCTCCGCCCCACTCCAAGCGCAACAACAGCGGAGACCACATCTCCCTATCTTCTCCGGCGGACTCCTATTCGTCGCCGCTTCACTCCAAGCACAACAGCGAGGACCACATCTCGCTCTCGCCGCCGGCAGGAAATTCGCCGGCGCGGTCCTCGGCCGGCTCCGAGCACATCACGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769400.1
MENQNNHPPPPETEAAPPPPLKSANHAPSPPHSKRNNSGDHISLSSPADSYSSPLHSKHNSEDHISLSPPAGNSPARSSAGSEHITINHSRGSSPEHERNRPPARSSLESEYITFDHGRRNEEPWPPAVVVRKDVYKGPMEDVVVVEEPTAVVNRAVLEEPKADPTPEVAGGGGGIRRRRVSPSLSILRRPEREKMVRKAALGFRVFGLLFCLVSFAVMAADRNQGWALDSFDRYKEFRYCMSVNVIGFVYSGAQALDMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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