当前解析结果
SmilChr06G002586| 统一新 Gene ID | SmilChr06G002586 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G002586 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G002586 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 37065944 - 37071211 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989420 |
|---|---|
| GeneID | 130989420 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989420 |
| 原始查询 | LOC130989420 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0171800; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os01g0171800; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G62960 (AT5G62960)UDP-N-acetylglucosamine-N-acetylmuramyl-pyrophosphoryl-undecaprenol N-acetylglucosamine protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836416] identity=45; qcov=0.985; evalue=2.19e-100; confidence=medium |
| Rice | Os01g0171800- identity=46.3; qcov=1; evalue=3.92e-102; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989420 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057769404.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057769404.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057769404.1 |
| 4 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.20000 | XP_057769404.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769405.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:37067882 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C40,C70 |
Chr6:37067916 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B46 |
Chr6:37069324 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr6:37069887 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr6:37069917 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C51,C74 |
Chr6:37069937 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,C73,C86 |
Chr6:37070017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,A14,A20,A3,B103 |
Chr6:37070094 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。