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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002596`

染色体: Chr06 坐标: 37199947-37203144 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002596`
名称	SmilChr06G002596
描述	uncharacterized SmilChr06G002596
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37199947 - 37203144 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989423`
GeneID	`130989423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989423`
原始查询	`LOC130989423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831313]; symbol=AT5G14610; hit=AT5G14610; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DEAD box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831313]; symbol=AT5G14610; hit=AT5G14610; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G14610` (AT5G14610) DEAD box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831313] identity=41.1; qcov=0.518; evalue=5.2e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0172200` (OsRH14) - identity=33.3; qcov=0.55; evalue=8.04e-19; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00397 (WW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769408.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769408.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769408.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769408.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37200163`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B41,B44,B93,C34,C40
`Chr6:37200163`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B41,B44,B93,C34,C40
`Chr6:37200170`	`GCC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B62,B85
`Chr6:37200179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C41,C65
`Chr6:37200183`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B62,B85
`Chr6:37200228`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C2
`Chr6:37200228`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C2
`Chr6:37200230`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B62,B85,B94,C16,C44,C81,D8
`Chr6:37200234`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr6:37200234`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr6:37200286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A22,B35,B62,B85,B94,C81
`Chr6:37200295`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B118,B138,B41,B67,B73,B76,B89,C22,C3,C55,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769408.1

338 aa

169

338

PF00397 WW 32-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769408.1`	Pfam	`PF00397`	WW	Domain	32	61	9.8e-08	32.6	WW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913425.1
TAGTTCTAATTCTCTCGTCACCCTTCAATAGTTGAAAGTAGTAGCCGTACGTGCCAATGGGCAATGGAGGATGTTTAAAGCAGAATTCTGCATCAATCTCAAATCAAGCTGCTGCAGCTGGTATTAGTTATGCACCTGAGGACCCTGCACTCCCAAAACCATGGAAGGGTCTGGTTGATGATAAGACTGGATACATTTACTATTGGAACCCAGAGACCAATATAACTCAATACGAGAAACTTGTTGCCCCTGGTCACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989423
ATGGGCAATGGAGGATGTTTAAAGCAGAATTCTGCATCAATCTCAAATCAAGCTGCTGCAGCTGGTATTAGTTATGCACCTGAGGACCCTGCACTCCCAAAACCATGGAAGGGTCTGGTTGATGATAAGACTGGATACATTTACTATTGGAACCCAGAGACCAATATAACTCAATACGAGAAACTTGTTGCCCCTGGTCACACAAGCTATGCGCCAGTTCATAAATCTTTGAGTTCATCGGTTCAGAAGTCCCCCCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769408.1
MGNGGCLKQNSASISNQAAAAGISYAPEDPALPKPWKGLVDDKTGYIYYWNPETNITQYEKLVAPGHTSYAPVHKSLSSSVQKSPQGRYNANDNDDRYSKASNGSTKASVPATRRRSYYSQSDVEVKVSVGYGPHTSNDAESIAAGAYCQCHDISVTGDKVPQPFTSFEATGFAPKILREGWDVTPDEVCQFHREVVTPDLGLGMMSQMRFSGSTSTHSTSTSQFPSTTFSTQIAQLQAELQQTQQREAALQAEMEERRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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