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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002625`

染色体: Chr06 坐标: 37814796-37818456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002625`
名称	SmilChr06G002625
描述	carbonic anhydrase 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37814796 - 37818456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989426`
GeneID	`130989426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989426`
原始查询	`LOC130989426`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carbonic anhydrase 2-like
产物	carbonic anhydrase 2-like
Arabidopsis	`AT3G01500` (CA1) carbonic anhydrase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821134] identity=72.2; qcov=0.886; evalue=4.07e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0639900` (BETACA1) - identity=55.4; qcov=0.586; evalue=4.38e-72; confidence=medium
GO	GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0015976 (carbon utilization)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00484 (Pro_CA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769412.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769412.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769412.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769412.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37815049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:37817851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:37817879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:37817941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr6:37818275`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C47,C51
`Chr6:37818275`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C47,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769412.1

333 aa

166

333

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 146-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769412.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	146	305	1.6e-41	142.9	Carbonic anhydrase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913429.1
CCATTGTATTTAAATTTACATGCATGCATTTCTCTCTCTAGAACTGTCTTCCCACCTTTCTCAATATAAAGGCGCCCAAATCCGACCCCCATTGAGCAATGTCGACTGTCAACGGCTGCCTCGCCTCCCAAATCTTCACCACCACCGCCTCCTCCCGCTCTAGAGTTGCCCTCCGCCCCGTTATCACCGCCCGCCTCAACTCCTCTCCGCCCAGCCTCATCCGGAACCAGCCCGTCTTCGCAGCTCCGCCTCCGATCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989426
ATGTCGACTGTCAACGGCTGCCTCGCCTCCCAAATCTTCACCACCACCGCCTCCTCCCGCTCTAGAGTTGCCCTCCGCCCCGTTATCACCGCCCGCCTCAACTCCTCTCCGCCCAGCCTCATCCGGAACCAGCCCGTCTTCGCAGCTCCGCCTCCGATCATCCACCCACTCTTGAAAGAAGACATGGGAAAGGACTCGTACGAAGAAGCCATTGCTGGACTCCAGAAGCTTCTGAGTGAGAATGGAGGGCTAGGACCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769412.1
MSTVNGCLASQIFTTTASSRSRVALRPVITARLNSSPPSLIRNQPVFAAPPPIIHPLLKEDMGKDSYEEAIAGLQKLLSENGGLGPVAAAKIEEITAELKTADGSASISSESVERLKTGFVTFKKEKYEKNPALYGELAKGQSPTYMVFACSDSRVCPSHVLDLQPGEAFVVRNVANLVPPFDQTKYAGVGAAVEYAVLHLKVKEIVVIGHSACGGIKGVMSFPYDGSSSTDFIEDWVKIALPAKNKTLADCGKDAPFGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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