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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002726`

染色体: Chr06 坐标: 39364115-39367112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002726`
名称	SmilChr06G002726
描述	uncharacterized SmilChr06G002726
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39364115 - 39367112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989427`
GeneID	`130989427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989427`
原始查询	`LOC130989427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0465000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0465000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G70180` (AT1G70180) Sterile alpha motif (SAM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843354] identity=60.7; qcov=0.213; evalue=2.28e-15; confidence=weak
Rice	`Os04g0465000` - identity=32.4; qcov=1.06; evalue=9.99e-23; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00536 (SAM_1); PF07647 (SAM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769413.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057769414.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769413.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769413.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39364991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:39365614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr6:39365656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:39365747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B131,B64,B83,C59
`Chr6:39366560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769413.1

322 aa

161

322

SAM_2

SAM_1

PF07647 SAM_2 252-305 aa PF00536 SAM_1 252-307 aa

XP_057769414.1

263 aa

132

263

SAM_2

SAM_1

PF07647 SAM_2 193-246 aa PF00536 SAM_1 193-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769413.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	252	305	1.6e-08	35.2	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057769413.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	252	307	2.2e-14	54.3	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057769414.1`	Pfam	`PF07647`	SAM_2	Domain	193	246	1.1e-08	35.8	SAM domain (Sterile alpha motif)
`XP_057769414.1`	Pfam	`PF00536`	SAM_1	Domain	193	248	1.4e-14	54.9	SAM domain (Sterile alpha motif)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913430.1
TCCACTAACTCACTAGTAACAAGATATTTGTAATAAATGAAGTGAGTGCAAAGTTTTTCTTTTTTGAAAAGGGGAGTACGAGTATTTATTAATGAACTAACAAATCTATTTCAATGAACGAGTCAAGTATATAAGAGTGATCAAAATTCAAAATCCTCCGTTCCTCAAGCGGTGGCATCTCTCTGGCTCTCTCATTCGATCGTCGCATACGCACGAGTCAACTCGGCCTCGAACTCGGTGAAGTTATTGGCAAATCATAA...

XM_057913431.1
TCCTCAAGCGGTGGCATCTCTCTGGCTCTCTCATTCGATCGTCGCATACGCACGAGTCAACTCGGCCTCGAACTCGGTGAAGTTATTGGCAAATCATAAAAATGGCGAAGCCCCATGTCACCATCACTCTCGGCAGCTCCGGTCAGCACCACTTTTGTGAAGAACCAAAGAATGCAGCTCATTTAGTGGTTGCTGCTGTGTTTCATGGTTGCTAGAAAGTGGTGAAGGATTCGTGGCGCGTCTCCGATGGAAATCGTGCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989427
ATGGCGAAGCCCCATGTCACCATCACTCTCGGCAGCTCCGGTCAGAAAGTGGTGAAGGATTCGTGGCGCGTCTCCGATGGAAATCGTGCGGCTGCGGCGGTGCCGATCGGGAGCAAAAGATCGCTGGAAGAGTCTCTTGGAAGCAGAGCTAATCACGCATTCAGTGGTAGCAAACGGATGAGAGATGGTGAGAGTGGAAGGAGCTATGGATACAGCAGCCACATTGATGATGATGAATTGGGTCCAAAAGATCTCCGCTT...

LOC130989427
ATGAGAGATGGTGAGAGTGGAAGGAGCTATGGATACAGCAGCCACATTGATGATGATGAATTGGGTCCAAAAGATCTCCGCTTGAAACTGACACGAAAGAGAATGTCGAGGGAGATAGAGCTCAAGAATGAGGGGTATAAAGGGACAGAGCTGCGTGAGAAGGTCTCAAGAGCAAGTCATTCTGATGATAGACTCCTAAAAGCCGTGCCATATTCAATGCGGGCTGCTGAGACTCCAATTATGGATTCATTGAGGAGTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769413.1
MAKPHVTITLGSSGQKVVKDSWRVSDGNRAAAAVPIGSKRSLEESLGSRANHAFSGSKRMRDGESGRSYGYSSHIDDDELGPKDLRLKLTRKRMSREIELKNEGYKGTELREKVSRASHSDDRLLKAVPYSMRAAETPIMDSLRSSYASWASTGGRARSPQRIPRPSGAIANPSSAMDRMLQVPSARPFDTSQREHVSTSNPLVSSRPNVPMVTGPRRALDSGKLPTELLTAAGSISRAPYQSSYVPKDSQPPTVSDFLH...

XP_057769414.1
MRDGESGRSYGYSSHIDDDELGPKDLRLKLTRKRMSREIELKNEGYKGTELREKVSRASHSDDRLLKAVPYSMRAAETPIMDSLRSSYASWASTGGRARSPQRIPRPSGAIANPSSAMDRMLQVPSARPFDTSQREHVSTSNPLVSSRPNVPMVTGPRRALDSGKLPTELLTAAGSISRAPYQSSYVPKDSQPPTVSDFLHSLGLWKYYINFQAEEVDMAALKQMGEIDLKELGIPMGPRKKILHALHPRPRPASLAHIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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