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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002659`

染色体: Chr06 坐标: 38432970-38434917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002659`
名称	SmilChr06G002659
描述	uncharacterized SmilChr06G002659
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38432970 - 38434917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989428`
GeneID	`130989428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989428`
原始查询	`LOC130989428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=27.9; qcov=0.519; evalue=2.13e-06; confidence=low
Rice	`Os02g0328500` - identity=33.1; qcov=0.465; evalue=2.78e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769415.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769415.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769415.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769415.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38433109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C8
`Chr6:38433129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B73,C72
`Chr6:38433174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C46,C56
`Chr6:38433186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B12,B2,B28,B79,B82,C18,C37,C73,C87,D4,D5
`Chr6:38433225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A10,B131,B38,B39,B42,B43,C14,C64,C66
`Chr6:38433226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,C33,C46,C56
`Chr6:38433233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B74,C2
`Chr6:38433237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:38433244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B16,B88,C24,C59
`Chr6:38433247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B139,B46,C46,C56
`Chr6:38433258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A2,A25,A8,B109,B112,B113,B129,B140,B17,B2,B20,B34,B49,B50,B73,B8,B89,B98,C12,C15,C26,C48,C57,C60,C76,C8,C80,C81,D11
`Chr6:38433282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913432.1
TATAACCACAGGTTATTATCTATATCATGTTTGATAGCTTAATAATTAATACCGAATTACACTAAATTGGTGTTTGATAGCAGTGTATTAAAATGCAGTAGAGTTAAATATTTGTTTGATACAGGATGTAGGAATGTAGTGTAATCATTGAAATTCCATTTATACCCTCAACTAACAATCAAATTTACTCACAATCTCCTTCACTCATTTCCAGCGGGAATTACTCAATGGGCGCCAATTAGATTTGCCCCCAAAAATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989428
ATGAGCTCTTCTCAACAAGCAACCGAGACAGCAAGTAACGATGTAGGGTGTGGGAAACCAACTAAAACGAACAAGACGCGGCGCAGTTGGACGCCGAGAGAGGAGGATGTGCTTCTTGCTGCTTTGAAAGAGCTTGTTGTGCAGGGTTGGAAGTCCGATAACGGCTTCCGCGCCGGGTATCTCGGAAAGTTGGAAGAAGCAGTCAAGAGCAGATTTCCAAACTCGAACCTCAAAGGAATGCCTCACATTCACTCAAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769415.1
MSSSQQATETASNDVGCGKPTKTNKTRRSWTPREEDVLLAALKELVVQGWKSDNGFRAGYLGKLEEAVKSRFPNSNLKGMPHIHSKIAAWKRNYYSLDLMLSNTGVGFNVDGTHMIDVNNEQWDQIVNKDPNACLMRFKSWPHLDAWKEIFGKDRATGGSAEDLLDAINDMQRADNLENNGDQGDYHVHLEEQAENDGAADSVCQGEKEQGIARGAGRKRKASGDGLDVLVDVFSEMGRNADKRVDCIASRMGYEFNLGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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